Veterinarski arhiv, Vol. 83 No. 1, 2013.
Izvorni znanstveni članak
Genska karakterizacija puranskih astrovirusa dokazanih u hrvatskim jatima peradi.
Marina Biđin
; Department of Poultry Diseases with Clinic, Faculty of Veterinary Medicine, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Darko Majnarić
; Veterinary Department Križevci, Croatian Veterinary Institute, Križevci, Croatia
Zdenko Biđin
; Department of Poultry Diseases with Clinic, Faculty of Veterinary Medicine, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Ivana Lojkić
; Department of Virology, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Sažetak
Opisana je identifikacija i genska karakterizacija puranskih astrovirusa (TAstV) dokazanih lančanom reakcijom polimerazom (PCR) u hrvatskim jatima purića i pilića. Organi uzorkovani od 16 jata purića i 7 jata pilića pretraženi su specifičnim početnicama na prisutnost puranskoga astrovirusa-1 (TAstV-1) i puranskoga astrovirusa-2 (TAstV-2). TAstV-1 dokazan je u 6 jata purića, a TAstV-2 u 4 jata purića i 2 jata pilića, što predstavlja prvi nalaz astrovirusa puranskog podrijetla u novog domaćina-kokoši. Umnoženi odsječci polimeraze bili su sekvencirani i analizirani. Filogenetska analiza temeljena je na sravnjivanju 82 aminokiseline izvedene iz 250 nukleotida (nt) sekvencije ORF 1b od ukupno 18 izolata puranskog astrovirusa. Molekulska i filogenetska analiza otkrile su postojanje jednog genotipa TAstV-2 i dva genotipa TAstV-1 dokazanih u komercijalnim jatima peradi u Hrvatskoj. Polimeraza je unutar obje skupine astrovirusa pokazala visoki stupanj postojanosti.
Ključne riječi
puranski astrovirus-1; puranski astrovirus-2; genska karakterizacija; filogenetska analiza
Hrčak ID:
97125
URI
Datum izdavanja:
11.2.2013.
Posjeta: 1.198 *