Izvorni znanstveni članak

Usporedba intraplazmidne rekombinacije u bakterijama Agrobacterium tumefaciens i Escherichia coli

Luka Bočkor orcid.org/0000-0002-2096-0944 ; ICGEB, AREA Science Park, Padriciano 99, IT-34149 Trieste, Italy
Srećko Jelenić† ; Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zavod za molekularnu biologiju, Horvatovac 102a, HR-10000 Zagreb, Hrvatska
Nenad Malenica ; Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zavod za molekularnu biologiju, Horvatovac 102a, HR-10000 Zagreb, Hrvatska
Jelena Mlinarec orcid.org/0000-0002-2627-5374 ; Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zavod za molekularnu biologiju, Horvatovac 102a, HR-10000 Zagreb, Hrvatska
Višnja Besendorfer ; Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zavod za molekularnu biologiju, Horvatovac 102a, HR-10000 Zagreb, Hrvatska
Ivana Ivančić-Baće orcid.org/0000-0003-2018-3150 ; Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zavod za molekularnu biologiju, Horvatovac 102a, HR-10000 Zagreb, Hrvatska

Sažetak

U ovom smo radu konstruirali plazmid koji nam je omogućio da usporedimo intraplazmidnu rekombinaciju u bakterijama Agrobacterium tumefaciens i Escherichia coli. Plazmid sadržava dvije istosmjerno ponovljene kopije gena odgovornog za rezistenciju na spektinomicin, pri čemu jednoj kopiji nedostaje 5', a drugoj 3' kraj gena, a međusobno su homologne u duljini od 570 pb. Osim toga, DNA koja se nalazi između ove dvije istosmjerno ponovljene sekvencije sadržava gen koji daje rezistenciju na antibiotik ampicilin. Homolognom rekombinacijom između nepotpunih gena za rezistenciju na spektinomicin nastaje funkcionalni gen, odgovoran za pojavu rezistencije. Pritom može doći do delecije gena za rezistenciju na ampicilin ili njegovog umnožavanja, zajedno s nepotpunim genima za otpornost na spektinomicin. Ovaj eksperimentalni sustav omogućio nam je da po prvi put pratimo pojavu delecija i amplifikacija tijekom intraplazmidne rekombinacije u bakteriji A. tumefaciens. Pokazali smo da delecije i amplifikacije u bakterijama Agrobacterium tumefaciens i Escherichia coli nastaju prvenstveno RecA-neovisnim mehanizmom. Osim toga, ustanovili smo da se delecije i amplifikacije pojavljuju s podjednakom učestalošću, što upućuje na to da je mehanizam oba rekombinacijska događaja sličan.

Ključne riječi

RecA; intramolekularna rekombinacija; Agrobacterium tumefaciens; Escherichia coli

Hrčak ID:

114446

URI

https://hrcak.srce.hr/114446

Datum izdavanja:

26.12.2013.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 1.560 *