Izvorni znanstveni članak
ISTRAŽIVANJE GENETSKE VARIJABILNOSTI UZGOJENIH I DIVLJIH POPULACIJA SOMA, Clarias gariepinus (Osteichthys: Clariidae), POMOĆU MARKERA SLUČAJNO UMNOŽENE POLIMORFNE DNA (RAPD)
Omoniyi Michael Popoola
; Department of Fisheries and Aquaculture Technology, Federal University of Technology, Akure, Nigeria
Emmanuel Adedayo Fasakin
; Department of Fisheries and Aquaculture Technology, Federal University of Technology, Akure, Nigeria
John Idowu Awopetu
; Department of Zoology, Obafemi Awolowo University, Ile-Ife, Nigeria
Sažetak
Analiza slučajno umnožene polimorfne DNA (RAPD) korištena je pri istraživanju genetske sličnosti i različitosti između tri uzgajane populacije i tri populacije iz otvorenih voda vrste Clarias gariepinus iz jugozapadne Nigerije.Genetska varijabilnost je analizirana kod tri populacije iz otvorenih voda Esaodoa (rijeka Osun), Owene (rijeka Owena) i Agbabua (rijeka Oluwa) i kod triju uzgajanih populacija: Akurea, Ilese i Ado-Ekitija. Sa svake lokacije prikupljeno je četrdeset živih jedinki (680 ± 3,28 g).Dobiveno je ukupno 435 produciranih crta iz šest populacija korištenjem devet RAPD početnica. Analiza molekularne varijance AMOVA ukazuje da se istraživane populacije međusobno značajno razlikuju i da se 99% ukupne varijabilnosti tiče različitosti unutar populacija. Postotak genetske istovjetnosti (GI) s RAPD-PCR analizom između šest proučavanih populacija kretao se od 74,6% do 83,5%. Također, genetska udaljenost vrste C. gariepinus iz šest populacija, temeljena na RAPD-PCR analizi, kretala se od 0,180 do 0,293. Napravljene su procjene genetskih varijacija kod populacija iz otvorenih voda i uzgajanih populacija vrste C. gariepinus, a ukupna i srednja vrijednost izdvojenih fragmenata bila je 71 (89,9%), 34,5 i 59 (74,7%), 35.4.Ukupna genska različitost između populacija iz otvorenih voda i uzgajanih populacija (Ht) bila je 0,3419 i 0,3010. Zaključeno je da postoji genetska varijabilnost i kod populacija iz otvorenih voda i kod uzgajanih populacija vrste C. gariepinus. Također, rezultati RAPD analize pokazali su međusobnu veću bliskost proučavanih jedinka populacija iz otvorenih voda i uzgajanih populacija nego onih između dvaju staništa. S obzirom na ukupne vrijednosti genske raznolikosti i ukupnog broja izdvojenih fragmenata, populacije iz otvorenih voda su znatno različitije nego uzgajane populacije.
Ključne riječi
Clarias gariepinus; RAPD; genska različitost; genetska varijacija
Hrčak ID:
119831
URI
Datum izdavanja:
31.3.2014.
Posjeta: 2.830 *