Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.14798/73.1.776
GENETSKA RAZLIČITOST AZIJSKOG MASLINASTOG CIPRINIDA (Systomus sarana, Hamilton, 1822) IZ NEKOLIKO RAZLIČITIH LOKACIJA U BANGLADEŠU
Md. Alamgir Kabir
; Department of Fisheries, University of Dhaka, Dhaka 1000, Bangladesh
Md. Ahashan Habib
; Tissue Culture Section, Bangladesh Council of Scientific and Industrial Research (BCSIR), Dhaka 1205, Bangladesh
Anwar Hossain
; Department of Fisheries, University of Dhaka, Dhaka 1000, Bangladesh
Shankar Chandra Mandal
orcid.org/0000-0002-0466-4440
; Department of Fisheries, University of Dhaka, Dhaka 1000, Bangladesh
Sažetak
Analizirani su uzorci Azijskog maslinastog ciprinida (Systomus sarana) s tri različite lokacije Kuliarchar, Bhairab i Bikrampur u Bangladešu radi utvrđivanja genetske raznolikosti putem slučajno amplificirane DNA pomoću lančane reakcije polimeraze (PCR-RAPD). Šest proizvoljnih oligonukleotida RAPD početnica korišteno je za amplifikaciju DNA iz svake populacije. Ukupno 52 benda su producirana na 3 populacije S. sarana, od čega je 28 bendova bilo polimorfno, što ukazuje na 53,84% polimorfizma u te tri populacije, s prosjekom od 9 bendova po početnici. Veličina amplificiranih fragmenta DNA kretala se u rasponu između 300 i 2300 bp. Uočeno je 12 jedinstvenih RAPD bendova u tri populacije. Bendovi su specifični i stabilni te stoga mogu biti korišteni za karakterizaciju svake germplazme. Vrijednosti genetskih udaljenosti bila je u rasponu između 0,5232 i 0,8109 s određenim stupnjem genetske varijacije između populacija. Najveća genetska udaljenost (0,8109) zabilježena je između S. sarana prikupljenih iz provincija Kuliarchar i Bikrampur, dok je najniža genetska udaljenost (0,5232) pronađena između jedinki prikupljenih iz provincija Kuliarchar i Bhairab. UPGMA dendrogram razdvaja tri uzoraka S. sarana u dva glavna klastera C1 i C2. Populacije Kuliarchar-Bhairab su genetski bliže nego Kuliarchar-Bikrampur. Stoga se RAPD analiza može koristiti za identifikaciju genetske raznolikosti vrste S. sarana. Ovi podaci se također mogu koristiti za poboljšanje uzgojnog programa i očuvanje populacija u otvorenim vodama.
Ključne riječi
tehnika RAPD-PCR; genomska DNA; DNA identifikacija; genetska raznolikost
Hrčak ID:
137587
URI
Datum izdavanja:
25.3.2015.
Posjeta: 1.354 *