Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.1515/aiht-2015-66-2631
Modeliranje vezivanja bakra(II) za pentapeptide povezane s atrijalnim natriuretičkim faktorom pomoću indeksa povezanosti 3χv
Ante Miličević
; Institute for Medical Research and Occupational Health, Zagreb, Croatia
Nenad Raos
; Institute for Medical Research and Occupational Health, Zagreb, Croatia
Sažetak
Služeći se teorijom molekularnih grafova istraživali smo vezivanje NSFRY-NH2 i 12 srodnih pentapetidnih amida za Cu(II) kao modelnog sustava za interakciju bakra s peptidnom molekulom atrijalnog natriuretičkog faktora (ANF). Modeli linarne regresije temeljeni na valencijskom indeksu povezanosti trećega reda (3χv) reproducirali su eksperimentalnu konstantu stabilnosti (log β) za komplekse koordinacije 1N, 2N, 3N i 4N sa standardnom pogreškom u rasponu od 0,30 do 0,39 log β jedinica. Razvili smo odvojene modele za sedam tirozinskih (N=28) i pet netirozinskih (N=20) peptida te skupni model s indikatorskom varijablom za obje vrste peptida (N=48). Rezultati upućuju na dodatnu aromatsku stabilizaciju u kompleksima vrste 4N zbog interakcija kationa s π-orbitalama tirozinskog ostatka, ali ne i fenilalaninskoga. Ispravili smo i pogrešne vrijednosti log K i log K* nastale omaškom u radu Anne Janicka-Klos i sur. 2013.
Ključne riječi
kompleksni spojevi; peptidi; konstante stabilnosti; topološki indeksi
Hrčak ID:
139894
URI
Datum izdavanja:
16.6.2015.
Posjeta: 1.056 *