Veterinarski arhiv, Vol. 91 No. 1, 2021.
Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0705
ioinformatička karakterizacija transmembranskog proteina gena 95 (TMEM95) u murah bivola (Bubalus bubalis)
Sampathirao Shireesha
; Department of Animal Genetics and Breeding, NTR College of Veterinary Science, Gannavaram, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Krovvidi Sudhakar
; Department of Animal Genetics and Breeding, NTR College of Veterinary Science, Gannavaram, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Regula Vinoo
; Department of Animal Genetics and Breeding, NTR College of Veterinary Science, Gannavaram, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Chappidi V. Seshaiah
; Livestock Farm Complex, NTR College of Veterinary Science, Gannavaram, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Muralidhar Metta
; Department of Animal Genetics and Breeding, College of Veterinary Science, Garividi, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Sažetak
Pri razmatranju plodnosti goveda, idiopatska neplodnost mužjaka često je zanemareno fenotipsko obilježje. S obzirom na gensku osnovu, smatra se da je obilježje povezano s genom TMEM9. U radu je, upotrebom DNA sekvencijskih informacija dobivenih od goveđeg TMEM95, provedena karakterizaciju tog gena u murah bivola. Uz bivola, fragment od ukupno 2.6 kb koji je ortologan govedima, sekvenciran je i u gir goveda. Delecija od 2 bp prisutna je u murah bivola što uzrokuje pogrešnu mutaciju u tri izoformna oblika prisutna u goveda. Funkcijski učinci nesinonimnih mutacija predviđani su primjenom SNAP2 programa koji je pokazao da nesinonimni SNP-i mogu utjecati na funkciju proteina. Funkcionalna bilješka motiva pokazala je prisustvo kazein kinaze II fosforilacijskog mjesta koje ima važnu ulogu u morfologiji spermija, zatim prisustvo leucin patentnog-zatvarača, N-miristoilacijskog mjesta, protein kinaze C-fosforilacijskog mjesta, CHRD domene profila, N-glikokosilacijskog mjesta i HIT motiva cinkovog prsta u goveda. U nijednoj od funkcionalnih izoformi u bivola nije prisutan HIT motiv cinkovog prsta. Rezultati skupno ukazuju da se gen subfertilnosti TMEM95 između goveda i bivola razvijao sa različitim funkcijama ali ima ulogu u muškoj plodnosti kao i u drugih sisavaca.
Ključne riječi
karakterizacija; TMEM95; murah bivol; idiopatska neplodnost
Hrčak ID:
255216
URI
Datum izdavanja:
6.4.2021.
Posjeta: 600 *