hrcak mascot   Srce   HID

Veterinarski arhiv, Vol. 91 No. 1, 2021.

Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0705

ioinformatička karakterizacija transmembranskog proteina gena 95 (TMEM95) u murah bivola (Bubalus bubalis)

Sampathirao Shireesha ; Department of Animal Genetics and Breeding, NTR College of Veterinary Science, Gannavaram, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Krovvidi Sudhakar ; Department of Animal Genetics and Breeding, NTR College of Veterinary Science, Gannavaram, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Regula Vinoo ; Department of Animal Genetics and Breeding, NTR College of Veterinary Science, Gannavaram, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Chappidi V. Seshaiah ; Livestock Farm Complex, NTR College of Veterinary Science, Gannavaram, Sri Venkateswara Veterinary University, India
Muralidhar Metta ; Department of Animal Genetics and Breeding, College of Veterinary Science, Garividi, Sri Venkateswara Veterinary University, India

Puni tekst: engleski, pdf (639 KB) str. 11-18 preuzimanja: 0* citiraj
APA 6th Edition
Shireesha, S., Sudhakar, K., Vinoo, R., Seshaiah, C.V. i Metta, M. (2021). Bioinformatic characterization of the Transmembrane protein95 gene (TMEM95) in Murrah buffalo (Bubalus bubalis). Veterinarski arhiv, 91 (1), 11-18. https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0705
MLA 8th Edition
Shireesha, Sampathirao, et al. "Bioinformatic characterization of the Transmembrane protein95 gene (TMEM95) in Murrah buffalo (Bubalus bubalis)." Veterinarski arhiv, vol. 91, br. 1, 2021, str. 11-18. https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0705. Citirano 10.04.2021.
Chicago 17th Edition
Shireesha, Sampathirao, Krovvidi Sudhakar, Regula Vinoo, Chappidi V. Seshaiah i Muralidhar Metta. "Bioinformatic characterization of the Transmembrane protein95 gene (TMEM95) in Murrah buffalo (Bubalus bubalis)." Veterinarski arhiv 91, br. 1 (2021): 11-18. https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0705
Harvard
Shireesha, S., et al. (2021). 'Bioinformatic characterization of the Transmembrane protein95 gene (TMEM95) in Murrah buffalo (Bubalus bubalis)', Veterinarski arhiv, 91(1), str. 11-18. https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0705
Vancouver
Shireesha S, Sudhakar K, Vinoo R, Seshaiah CV, Metta M. Bioinformatic characterization of the Transmembrane protein95 gene (TMEM95) in Murrah buffalo (Bubalus bubalis). Veterinarski arhiv [Internet]. 2021 [pristupljeno 10.04.2021.];91(1):11-18. https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0705
IEEE
S. Shireesha, K. Sudhakar, R. Vinoo, C.V. Seshaiah i M. Metta, "Bioinformatic characterization of the Transmembrane protein95 gene (TMEM95) in Murrah buffalo (Bubalus bubalis)", Veterinarski arhiv, vol.91, br. 1, str. 11-18, 2021. [Online]. https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0705

Sažetak
Pri razmatranju plodnosti goveda, idiopatska neplodnost mužjaka često je zanemareno fenotipsko obilježje. S obzirom na gensku osnovu, smatra se da je obilježje povezano s genom TMEM9. U radu je, upotrebom DNA sekvencijskih informacija dobivenih od goveđeg TMEM95, provedena karakterizaciju tog gena u murah bivola. Uz bivola, fragment od ukupno 2.6 kb koji je ortologan govedima, sekvenciran je i u gir goveda. Delecija od 2 bp prisutna je u murah bivola što uzrokuje pogrešnu mutaciju u tri izoformna oblika prisutna u goveda. Funkcijski učinci nesinonimnih mutacija predviđani su primjenom SNAP2 programa koji je pokazao da nesinonimni SNP-i mogu utjecati na funkciju proteina. Funkcionalna bilješka motiva pokazala je prisustvo kazein kinaze II fosforilacijskog mjesta koje ima važnu ulogu u morfologiji spermija, zatim prisustvo leucin patentnog-zatvarača, N-miristoilacijskog mjesta, protein kinaze C-fosforilacijskog mjesta, CHRD domene profila, N-glikokosilacijskog mjesta i HIT motiva cinkovog prsta u goveda. U nijednoj od funkcionalnih izoformi u bivola nije prisutan HIT motiv cinkovog prsta. Rezultati skupno ukazuju da se gen subfertilnosti TMEM95 između goveda i bivola razvijao sa različitim funkcijama ali ima ulogu u muškoj plodnosti kao i u drugih sisavaca.

Ključne riječi
karakterizacija; TMEM95; murah bivol; idiopatska neplodnost

Hrčak ID: 255216

URI
https://hrcak.srce.hr/255216

[engleski]

Posjeta: 0 *