Pregledni rad

Određivanje aminokiselinske sekvencije farmaceutskih peptida MALDI-TOF tandemnom spektrometrijom masa

Mario Cindrić ; Institut Ruđer Bošković, Odjel za molekularnu medicinu, Zagreb, Hrvatska
Mirela Sedić ; Institut Ruđer Bošković, Odjel za molekularnu medicinu, Zagreb, Hrvatska
Anita Horvatić ; Institut Ruđer Bošković, Odjel za molekularnu medicinu, Zagreb, Hrvatska
Ivana Dodig ; Institut Ruđer Bošković, Odjel za molekularnu medicinu, Zagreb, Hrvatska

Sažetak

Iako su mehanizmi preddisocijacije, disocijacije i postdisocijacije iona izučavani dugi niz godina, postoji još cijeli niz mehanizama raspada iona koji se mogu korisno upotrijebiti u modernoj spektrometriji masa, proteomici i bioanalizama. Nedvojbena aminokiselinska analiza spektrometrijom masa počiva na ideji da samo jedan i kontinuirani slijed iona u tandemnom spektru masa može potpuno potvrditi cjelovitu aminokiselinsku sekvenciju i na taj način zadovoljiti zahtjeve nedvojbene analize peptida. Niz pravila kojima se definira cjelovita i nedvojbena analiza peptida tandemnom spektrometrijom masa u konačnici može unaprijediti iščitavanje rezultata analize i pouzdanost dobivenih podataka. Na teorijskim zasadama disocijacije iona u plinskoj fazi u ovom je radu prikazana cjelovita analiza peptida. Na modelnim farmaceutskim peptidima bivalirudinu i eksenatidu pokazano je kako se i bez raširene upotrebe derivatizacijskih tehnika (SPITC i Lys-tag) može ostvariti nedvojbena analiza, iako se modifikacije cisteina akrilacijom, metilacijom ili karboksimetilacijom pri tome ne mogu izbjeći.

Ključne riječi

MALDI-TOF/TOF; određivanje aminokiselinske sekvence; farmaceutski peptidi; bivalirudin; eksenatid

Hrčak ID:

63153

URI

https://hrcak.srce.hr/63153

Datum izdavanja:

15.12.2010.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 3.177 *