Izvorni znanstveni članak

Usporedba vrijednosti dvaju različitih kompleta početnica za dokaz vrste Pasteurella caballi lančanom reakcijom polimerazom u uzorcima bronhoalveolarnog ispirka ždrebadi čistokrvnoga arapskog konja.

Zafer Sayin ; Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Selcuk, Selcuklu, Konya, Turkey
Osman Erganis ; Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Selcuk, Selcuklu, Konya, Turkey
Asli Sakmanoglu ; Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Selcuk, Selcuklu, Konya, Turkey
Hasan H. Hadimli ; Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Selcuk, Selcuklu, Konya, Turkey
Yasemin Pinarkara ; Department of Food Technology, Sarayonu Vocational School, University of Selcuk, Sarayonu, Konya, Turkey
Mehmet Maden ; Department of Internal Medicine, Faculty of Veterinary Medicine, University of Selcuk, Selcuklu, Konya, Turkey
Huda J. G. Al Shattrawi ; Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Selcuk, Selcuklu, Konya, Turkey

Sažetak

Pasteurella caballi (P. caballi) izdvojena je i identificirana u uzorcima bronhoalveolarnog ispirka i tkiva pluća ždrebadi čistokrvnoga arapskoga konja uobičajenim mikrobiološkim postupcima. Potom je istražena vrijednost dvaju različitih kompleta početnica za dokaz i potvrdu vrste P. caballi lančanom reakcijom polimerazom. Početnica 1 za dokaz gena 16S rRNA P. caballi bila je pripremljena upotrebom programa Primer 3, a početnica 2 upotrebom programa Primer-BLAST. Lančana reakcija polimerazom rabljena je za potvrdu sojeva vrste P. caballi i za njezin izravni dokaz u uzorcima bronhoalveolarnog ispirka i plućnoga tkiva. Ukupno je bilo izdvojeno 35 izolata Pasteurella spp. iz 25 (38,4 %) od 65 pretraženih uzoraka bronhoalveolarnog ispirka i 10 (58,8 %) izolata iz 17 uzoraka plućnoga tkiva. Ti su sojevi bili identificirani na osnovi poznatih mikrobioloških i biokemijskih značajki. Početnice 1 i 2 pokazale su 100 %-tnu osjetljivost za identifikaciju uzgojenih sojeva. Međutim, početnica set-1 za dokaz vrste P. caballi bila je slabije specifičnosti od početnice set-2 pri pretrazi uzoraka bronhoalveolarnog ispirka i plućnoga tkiva. Osjetljivost i specifičnost početnice 2 bila je povrđena analizom genske sekvencije. Istraživanje pokazuje da početnica set-2 za lančanu reakciju polimerazom za dokaz 16S rRNA pruža brz i točan alat za dokazivanje i potvrdu izolata vrste P. caballi u bronhoalveolarnom ispirku i plućnom tkivu ždrebadi.

Ključne riječi

arapski konj; ždrebad; Pasteurella caballi; lančana reakcija polimerazom; Primer-BLAST; Primer 3; 16S rRNA

Hrčak ID:

156705

URI

https://hrcak.srce.hr/156705

Datum izdavanja:

22.4.2016.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 1.730 *