Izvorni znanstveni članak

https://doi.org/10.46419/vs.52.5.8

Molekularna istraživanja na rajanpuri soju pasmine beetal koza iz Pakistana potpunim područjem pomaka mtDNK i mikrosatelitnim markerima

Abdul Wajid ; Department of Molecular Biology, Virtual University of Pakistan, Lahore, Pakistan
Tanveer Hussain ; Department of Molecular Biology, Virtual University of Pakistan, Lahore, Pakistan
Faiz M. M. T. Marikar orcid.org/0000-0003-4579-7263 ; General Sir John Kotelawala Defense University, Ratmalana, Sri Lanka
Muneeb M. Musthafa ; Faculty of Technology, South Eastern University, Oluvil, Sri Lanka
Kamran Abbas ; Department of Molecular Biology, Virtual University of Pakistan, Lahore, Pakistan
Akhtar Ali ; Department of Molecular Biology, Virtual University of Pakistan, Lahore, Pakistan
Masroor E. Babar ; Department of Molecular Biology, Virtual University of Pakistan, Lahore, Pakistan

Sažetak

Mitohondrijske DNK sekvence DNK-D petlji (mtDNK) 105 jedinki (11 ratalpuri sojeva beetal koze i 94 sekvence iz GenBank) od 19 geografskih i fenotipičnih domaćih pasmina koza u Pakistanu rabljeno je u ovom eksperimentu. U ovoj smo studiji istražili varijabilnost i njezinu molekularnu filogeniju. Zamijećen je ukupno 81 različit haplotip u 105 jedinki s raznolikošću haplotipova 0,984±0,006 i nukleotidnom raznolikošću 0,03953±0,00843. Filogenetskom analizom ustvrđen iz mtDNK hipervarijabilni segment (HVI) kontrolnog područja (481 bp) i pokazala je četiri haploskupine mtDNK (A, B1, C i D) identificirane u pakistanskih domaćih koza, u kojima se haploskupina A (84,11 %) pokazala dominantnom i široko rasprostranjenom među svim istraživanim pasminama. Studija je otkrila da svi haplotipovi rajanpuri soja pripadaju haploskupini A. Rajanpuri je rijedak lokalni soj beetal pasmine koza smješten u zapadnoj regiji provincije Punjab u Pakistanu. Rezultati genetske raznolikosti na temelju 11 mikrosatelitnih lokusa otkrili su alelnu raznolikost (3,6363) i visoku genetsku raznolikost (0,8342) istraživane rajanpuri pasmine koza. Rezultati analize za potpis za događaje uskog grla uporabom tri modela otkrili su značajno odstupanje rajanpuri koza od ravnoteže mutacija i pomaka. Kvalitativni test analize modalnog pomaka podržao je i rezultate dobivene trima modelima, ukazujući na prisutnost genetskog uskog grla u rajanpuri soja u nedavnoj prošlosti. Ova studija po prvi put pruža informacije o arhitekturi mtDNK, genetskoj raznolikosti, analizi uskog grla koje će biti korisne u donošenju odluke o očuvanju i upravljanju cijenjenom i skupocjenom rajanpuri kozom.

Ključne riječi

mtDNK D-petlja; filogenetska analiza; mikrosatelitni marker; analiza uskog grla; rajanpuri koza; Pakistan

Hrčak ID:

248800

URI

https://hrcak.srce.hr/248800

Datum izdavanja:

1.2.2021.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 1.186 *