Veterinary Archives, Vol. 91 No. 5, 2021.
Original scientific paper
https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.1038
Povezanost varijacija gena STAT5B sa proizvodnjom mlijeka i svojstvima mastitisa u mliječnih goveda
Nawab Ali
; College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Abdul Wali Khan University Mardan, Pakistan; Department of Zoology, Abdul Wali Khan University Mardan, Pakistan; College of Animal Sciences and Technology, China Agriculture University Beijing, China
Sadaf Niaz
; Department of Zoology, Abdul Wali Khan University Mardan, Pakistan
Irfan Khattak
; College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Abdul Wali Khan University Mardan, Pakistan
Naimat U. Khan
; College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Abdul Wali Khan University Mardan, Pakistan
Hanpeng Luo
; College of Animal Sciences and Technology, China Agriculture University Beijing, China
Hazir Muhammad
; Department of Biotechnology, Abdul Wali Khan University Mardan, Pakistan
Tariq Ali
; Center for Microbiology and Biotechnology, Veterinary Research Institute, Peshawar, Pakistan
Ying Yu
; College of Animal Sciences and Technology, China Agriculture University Beijing, China
Yachun Wang
; College of Animal Sciences and Technology, China Agriculture University Beijing, China
Tahir Usman
; College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Abdul Wali Khan University Mardan, Pakistan
Abstract
Proizvodnja i zdravlje vimena su zahtjevna svojstva u uzgoju mliječnih goveda. Cilj je ovog rada bio je istražiti povezanost polimorfizma pojedinačnih nukleotidnih (SNPs) gena STAT5B u mliječnih goveda sa svojstvima proizvodnje mlijeka i mastitisa. Istraživanje je uključilo 201 kravu s četiri mliječne farme iz pokrajine Khyber Pakhtunkhwi u Pakistanu, među kojima su bile jedinke čistokrvnih pasmina (Holstein Friesian, Jersey i Achai) i križanci. U uzorcima mlijeka analizirani su broj somatskih stanica (SCC) i sastav mlijeka (postotak masnoće, proteina i laktoze). Generalizirani linearni model, uz uporabu SAS statističkog programa, poslužio je za analizu povezanosti. Sekvenciranje DNA pokazalo je fond od četiri (tri sinonimna i jedan 3/ UTR) SNP-a u genu STAT5B. Ovi su pojedinačni nukleotidni polimorfizmi dodatno potvrđeni u svim uzorcima DNA primjenom testa SNaPshot. Analiza pasmina pokazala je da većina SNP-a odgovara Hardy-Weinbergovoj ravnoteži (P>0,05). Istraživanje povezanosti pokazalo je znakovito veći postotak proteina u genotipu TT i manji broj SCC-a u CC genotipu SNP-a 1 (ekson 2, C > T), dok je u SNP-u 2 (ekson 16, T > C), genotip TT pokazao znakovito manji broj SCC-a i SCS-a u usporedbi s drugim genotipovima (P < 0,05). SNP 4 (3/ UTR, C>T) pokazao je znakovito manji broj SCC-a i učestalost kliničkog mastitisa u heterozigotnog (CT) genotipa u usporedbi s homozigotnim genotipovima. In silico predikcija pokazala su promjene u RNA sekundarnoj strukturi za SNP 2 i SNP 3. Rezultati pokazuju da bi se STAT5B trebao uzeti u obzir kao kandidatni gen, a njegove varijante kao koristan genski biljeg za poboljšanje sastava mlijeka i zdravlja vimena.
Keywords
mliječne krave; mastitis; svojstva mlijeka; STAT5B; SNP
Hrčak ID:
271523
URI
Publication date:
12.12.2021.
Visits: 880 *