Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.2478/cjf-2022-0013
GENETSKA DIFERENCIJACIJA I MOLEKULARNA FILOGENETIKA AFRIČKOG SOMA IZ TRI RAZLIČITE VODE
Omoniyi Michael Popoola
orcid.org/0000-0003-2175-9174
; Department of Fisheries and Aquaculture Technology, Federal University of Technology, Akure, Nigeria Aquatic Environmental Biotechnology & Nanotechnology Division, ICAR-Central Inland Fisheries Research Institute, Barrackpore, Kolkata-700 120 West Bengal, India
Sažetak
Populacijska struktura i genetska varijabilnost afričkog soma istražena je korištenjem djelomičnih sekvenci mitohondrijske DNA citokroma b. Pedeset četiri (54) uzorka su istražena iz tri zemljopisno izolirane rijeke u Nigeriji. Analiza 53 haplotipa pokazala je veću raznolikost haplotipova (0,99930) i nukleotidnu raznolikost (p) (0,07270). Prema analizi molekularne varijance (AMOVA), genetska raznolikost afričkog soma unutar populacija značajno je veća od genetske raznolikosti među populacijama. FST rezultati (0,75000, 0,94792 i 0,95699) pokazuju da populacije afričkog soma u tri nigerijska slatkovodna tijela imaju snažnu genetsku strukturu. Filogenetska rekonstrukcija jedinstvenih haplotipova otkrila je postavljanje haplotipa (Ogbese) povezanog s drugima iz sve tri skupine točkastom mutacijom u rasponu od 1 do 24 nukleotida. Populacije afričkog soma u rijekama Asejire i Ureje genetski su raznolike, što dokazuje visoka razina raznolikosti haplotipa od 1,0000, niska raznolikost nukleotida u rasponu od 0,05101 do 0,07889, te visoke vrijednosti FST-a (genetske varijacije unutar populacije). Zajednički haplotipovi između nekih populacija i mješavine haplotipova iz različitih populacija unutar istog genetskog klastera pokazuju da se genetska struktura populacija ne razlikuje.
Ključne riječi
C. gariepinus; citokrom b; Median – joining filogenetska mreža; supstitucija nukleotida; genetske udaljenosti
Hrčak ID:
281597
URI
Datum izdavanja:
2.9.2022.
Posjeta: 487 *