Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.2478/aiht-2024-75-3817
Dekodiranje molekulskog aspekta oštećenja oka prouzročenog ionizirajućim zračenjem pomoću rudarenja genomskih podataka
Katarina Baralić
; University of Belgrade Faculty of Pharmacy, Department of Toxicology “Akademik Danilo Soldatović“, Belgrade, Serbia
Predrag Božović
; University of Belgrade Vinča Institute of Nuclear Sciences, Department of Radiation and Environmental Protection, Belgrade, Serbia
Danijela Đukić-Ćosić
; University of Belgrade Faculty of Pharmacy, Department of Toxicology “Akademik Danilo Soldatović“, Belgrade, Serbia
Sažetak
Izloženost ionizirajućem zračenju čak i pri niskim razinama može pridonijeti nastanku oštećenja oka. Međutim, osnovni molekulski mehanizmi i dalje nisu potpuno razjašnjeni. Cilj našega istraživanja bio je ispuniti tu nedostajuću kariku primjenom sveobuhvatnog in silico pristupa problemu. U tu svrhu, pomoću genomskih baza podataka, portala i poslužitelja (Comparative Toxicogenomics Database, ToppGene Suite portal, Cytoscape, GeneMANIA i Metascape), identificirano je šest ključnih regulacijskih gena koji su povezani s oštećenjem oka prouzročenog ionizirajućim zračenjem (ATM, CRYAB, SIRT1, TGFB1, TREX1 i YAP1) i koji su svi bili u fizičkoj interakciji. Neke od identificiranih molekulskih funkcija odnosile su se na mehanizme popravka oštećenja DNA, a druge su bile uključene u vezanje proteina, enzimsku aktivnost, metaboličke procese i posttranslacijske modifikacije proteina. Biološki procesi uglavnom su bili povezani s odgovorom na oštećenje DNA, pogotovo sa signalnim putem p53. Uočena je i značajna uloga nekoliko miRNA, poput hsa-miR-183 i hsa-miR-589, u mehanizmima povezanima s oštećenjem oka prouzročenog ionizirajućim zračenjem. Osim toga, u ovom je istraživanju opisana korisna metoda za ispitivanje štetnih učinaka izloženosti zračenju.
Ključne riječi
istraživanje podataka; oštećenje DNA; miRNAs; oštećenje oka; biološki učinci zračenja
Hrčak ID:
318095
URI
Datum izdavanja:
19.6.2024.
Posjeta: 0 *