Veterinarski arhiv, Vol. 94 No. 6, 2024.
Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.2472
Identifikacija pojedinačnih nukleotidnih varijacija gena AGPAT6 i njihova povezanost sa svojstvima proizvodnje mlijeka u vodenih bivola pasmine Murrah
Sapna Nath
orcid.org/0000-0003-3873-0669
; Animal Breeding Research Centre, Indian Council of Agricultural Research National Dairy Research Institute, Karnal, India
*
Dayal Nitai Das
; Dairy Production Section, Indian Council of Agricultural Research-National Dairy Research Institute, Southern Regional Station, Bengaluru, India
Satish Kumar Illa
; Animal Genetics and Breeding Division, Dairy Production Section, Indian Council of Agricultural Research - National Dairy Research Institute, Karnal, India
Anand Kumar Nagaleekar
; Animal Genetics and Breeding Division, Dairy Production Section, Indian Council of Agricultural Research - National Dairy Research Institute, Karnal, India
Deginal Revanasiddu
; Animal Genetics and Breeding Division, Dairy Production Section, Indian Council of Agricultural Research - National Dairy Research Institute, Karnal, India
* Dopisni autor.
Sažetak
U radu je istraživana povezanost genskih varijacija unutar 5′UTR eksona 1-1511, 3′UTR eksona 1512-1723 gena sn-1-acylglycerol-3-phosphate-O-acyltransferase 6 (AGPAT6) sa svojstvima proizvodnje mlijeka u vodenih bivola. U 100 jedinki pasmine Murrah su uporabom PCR:SSCP i Sangerove metode sekvenciranja otkrivena dva jedinstvena konformacijska uzorka, 1 i 2. Za amplifikaciju gena AGPAT6 upotrijebljeno je deset početnica, a ukupno je identificirano devet pojedinačnih nukleotidnih polimorfizama (SNPs): dva u eksonu 4 i sedam u eksonu 8. Ustanovljeno je da je u populaciji istraživanih bivola učestalost SSCP uzorka 1 konzistentno visoka. Preliminarni su rezultati pokazali znatne varijacije u raspodjeli učestalosti SSCP varijanti obrazaca 1 i 2 u vodenih bivola pasmine Murrah. Te varijante eksona 4 i eksona 8 nisu bile znakovito povezane s prinosom mlijeka, dok je za iste varijante u smislu SNP-ova u kodirajućoj regiji utvrđeno da su znakovito povezane (P≤0,01) s postotkom mliječne masti. Navedeno upućuje na zaključak da gen AGPAT6 utječe na postotak mliječne masti. Budući da se radi o ekonomski važnom svojstvu, analizirani polimorfizmi mogli bi se upotrijebiti kao molekularni markeri u uzgojno-selekcijskom radu što istraživanja AGPAT6 gena u vodenih Murrah bivola čini dodatno opravdanim.
Ključne riječi
gen AGPAT6; učinak supstitucije alela; vodeni bivoli Murrah; sadržaj mliječne masti; SNP; (PCRSSCP)
Hrčak ID:
322072
URI
Datum izdavanja:
1.11.2024.
Posjeta: 0 *