Veterinary Archives, Vol. 82 No. 5, 2012.
Original scientific paper
Filogenetska analiza hrvatskih izolata virusa virusnog proljeva goveda.
Tomislav Bedeković
; Department of Virology, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Ivana Lojkić
orcid.org/0000-0003-1559-9020
; Department of Virology, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Nina Lemo
; Department of Virology, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Željko Čač
; Department of Virology, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Željko Cvetnić
; Department of Virology, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Mirko Lojkić
; Department of Virology, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Josip Madić
; Department of Microbiology and Infectious Diseases with Clinic, Faculty of Veterinary Medicine, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Abstract
Od 2007. do 2011. godine na virus virusnog proljeva goveda (VPG) pretraženi su uzorci pet slezena i 1937 uzoraka seruma podrijetlom iz 9 stada mliječnih goveda. Imunoperoksidaznim testom (IP) u 13 je uzoraka dokazan necitopatogeni biotip virusa VPG te je potvrđena perzistentna zaraza. Iz svih pet uzoraka slezena izdvojen je citopatogeni virus VPG. U svrhu genotipizacije vlastitih izolata virusa VPG, iz nadtaloga inficiranih staničnih kultura izdvojena je virusna RNK i umnožena lančanom reakcijom polimerazom uz prethodnu reverznu transkripciju (RT-PCR). Umnoženi odsječci 5’-UTR i gena Npro su potom sekvencirani. Filogenetska analiza hrvatskih izolata virusa VPG pokazala je da svi pretraženi izolati pripadaju genotipu 1; 11 izolata svrstano je u podtip 1b, a 7 u 1f. Filogenetska analiza na temelju spojene 5’-UTR/Npro genske sekvencije potvrdila je rezultate genotipizacije pretraženih izolata. Na Npro dijelu genoma utvrđeno je pet aminokiselinskih promjena osebujnih za hrvatske izolate iz podtipa 1f.
Keywords
virusni proljev goveda; imunoperoksidazni test; gen Npro; filogenetska analiza
Hrčak ID:
86254
URI
Publication date:
11.9.2012.
Visits: 1.460 *