Veterinary Archives, Vol. 86 No. 4, 2016.
Original scientific paper
Analiza haplotipova genski polimorfnog hormona rasta američke vidrice (Neovison vison) pomaže objasniti razloge za njihovu vezanu neravnotežu i razlikovanje po predcima.
Jakub J. Skorupski
orcid.org/0000-0001-6899-701X
; Department of Ecology and Environmental Protection, Faculty of Biology, University of Szczecin, Szczecin, Poland; Department of Genetics and Animal Breeding, Faculty of Biotechnology and Animal Husbandry, West Pomeranian University of Technology, Szczecin
Abstract
Kod 389 američkih vidrica (Neovison vison) analizirani su haplotipovi gena za hormone rasta. Od diploidnih multilokusnih genotipova, među kojima je utvrđeno 14 polimorfnih lokusa, identificirana su 44 različita haplotipa. Signifikantna neravnoteža gameta javlja se u slučaju 4 varijabilna mjesta, s koeficijentom korelacije u rasponu od 50% do 94%. Definirana su 4 haplotip bloka. Rezultati D-statistike za istraženu populaciju upućuju da su opažene vezane neravnoteže uzrokovane ograničenom migracijom i genskim pomakom. Osim toga, opisana vezana neravnoteža pokazuje relativno nisku učestalost rekombinacija između varijabilnih genskih lokusa za hormon rasta američke vidrice. Konstruirani kladogram otkriva postojanje dviju potpuno različitih i unutar sebe konzistentnih kladi, što može ukazivati na dva glavna obrasca za haplotipove predaka, od kojih su izvedeni svi drugi haplotipovi. Također, unutarnja građa kladograma otkriva njihov jasan hijerarhijski raspored, što omogućuje zaključke o podrijetlu odnosa između utvrđenih haplotipova.
Keywords
američka vidrica; genetski polimorfizam; gen za hormone rasta; analiza haplotipa; vezana neravnoteža; Ohta D-statistika
Hrčak ID:
166041
URI
Publication date:
12.8.2016.
Visits: 1.089 *