Original scientific paper

https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.160229a

Povezanost novog polimorfizma pojedinačnog nukleotida u eksonu 2 gena za inzulinu sličan faktor rasta 1 (IGF1) s fenotipskim varijantama u koza

Thomas Naicy orcid.org/0000-0001-8857-5551 ; Department of Animal Breeding, Genetics and Biostatistics, College of Veterinary and Animal Sciences, Mannuthy, Thrissur, Kerala, India
Thirupathy Venkatachalapathy ; Centre for Advanced Studies in Animal Genetics and Breeding, College of Veterinary and Animal Sciences, Mannuthy, Thrissur, Kerala, India
Thazhathuveettil Aravindakshan ; Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary and Animal Sciences, Mannuthy,
Kunniyoor C. Raghavan ; Centre for Advanced Studies in Animal Genetics and Breeding, College of Veterinary and Animal Sciences, Mannuthy, Thrissur, Kerala, India
Mangattumuruppel i Mini ; Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary and Animal Sciences, Mannuthy, Thrissur, Kerala, India
Kulangara Shyama ; Department of Animal Nutrition, College of Veterinary and Animal Sciences, Mannuthy, Thrissur, Kerala, India

Abstract

Inzulinu sličan faktor rasta 1 (IGF1) ima ključnu ulogu u razvoju ploda i postnatalnom rastu. Cilj je ovog istraživanja bio okarakterizirati cijelu kodirajuću sekvenciju IGF1 gena koza u dvije autohtone pasmine iz Indije: malabari i crna atapadi. S tim u vezi željelo se utvrditi polimorfizme IGF1 gena i istražiti njihove učinke na obilježja tjelesne razvijenosti, te ustanoviti relativnu ekspresiju IGF1 mRNA u mišićnom tkivu koza s malom i velikom tjelesnom masom. Kod 298 koza umnožena su sva 4 eksona IGF1 gena i okarakterizirana uz pomoć PCR-SSCP. Na eksonu 2 utvrđena su dva genotipa (CC i CT). Analiza sekvencije PCR produkata od svakog genotipa pokazala je novi polimorfizam pojedinačnog nukleotida, g. 80C>T (GenBank No. KM974180) koja je uzrokovala neistovjetnu mutaciju (Thr48Met) i razlike u strukturi proteina IGF1. Analiza povezanosti lokusa pokazala je da CT genotipovi imaju u odnosu na CC genotipove veću dužinu tijela (P<0,01), veći opseg prsiju (P<0,01) i veći indeks dužine tijela (P<0,05). Dva nova PCR-RFLP-a su označena za brzu detekciju genotipova. Kvantitativna PCR analiza u stvarnom vremenu pokazala je nesignifikantne razlike (P>0,05) u ekspresiji IGF1 mRNA u mišićnom tkivu koza s malim i velikim tjelesnim masama. Rezultati istraživanja upućuju da bi alele IGF1 gena mogli smatrati ciljanom skupinom za unaprjeđenju obilježja rasta u koza.

Keywords

koza; ekspresija gena; rast; IGF1; polimorfizam jednolančane konformacije; qRT-PCR; polimorfizam pojedinačnog nukleotida

Hrčak ID:

185643

URI

https://hrcak.srce.hr/185643

Publication date:

3.7.2017.

Article data in other languages: english

Visits: 1.687 *