Veterinarska stanica, Vol. 48 No. 5, 2017.
Review article
Metode izdvajanja i dokazivanja bakterija roda Campylobacter – metode genotipizacije (II. dio)
Marina Mikulić
; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Andrea Humski
; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Bela Njari
; Veterinarski Fakultet Sveučilišta u Zagrebu, Hrvatska
Dora Stojević
; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Luka Jurinović
; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Silvio Spičić
; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Sanja Duvnjak
; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Željko Cvetnić
; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Abstract
Različite metode genotipizacije omogućuju razlikovanje bakterijskih sojeva ispod razine vrste ili podvrste. Gel elektroforeza u pulsirajućem polju (PFGE) neprestano se usavršava od 1980-tih godina i do danas je upotrebljavaju mnogi javnozdravstveni laboratoriji. Od ostalih metoda koriste se: metoda analize duljine polimorfizma restrikcijskih odsječaka (RFLP), metoda nasumično umnoženih poliformnih odsječaka (RAPD) i metoda ribotipizacije. Određivanje redoslijeda nukleotidnih sljedova unutar DNK naziva se sekvenciranje. Na osnovi sekvenciranja bazira se rad novih metoda tipizacije određivanjem sljedova nukleotida na više genskih lokusa poput MLST, rMLST i cgMLST. One istražuju odnose između bakterija roda Campylobacter, posebice C. jejuni i C. coli. Korisne su u istraživanju mogućih izvora i rezervoara uzročnika bolesti, njihovih odnosa te molekularne epidemiologije bolesti. Metoda sekvenciranja cijelog genoma (WGS) u mikrobiologiji revolucionarna je metoda za koju se smatra da će postupno zamijeniti ostale metode genotipizacije.
Keywords
Campylobacter spp.; razlikovanje sojeva; tipizacija sekvenciranjem; PFGE
Hrčak ID:
222644
URI
Publication date:
15.10.2017.
Visits: 1.862 *