Veterinarska stanica, Vol. 52 No. 5, 2021.
Original scientific paper
https://doi.org/10.46419/vs.52.5.8
Molekularna istraživanja na rajanpuri soju pasmine beetal koza iz Pakistana potpunim područjem pomaka mtDNK i mikrosatelitnim markerima
Abdul Wajid
; Zavod za molekularnu biologiju, Univerzitet Virtual u Pakistanu, Lahore, Pakistan
Tanveer Hussain
; Zavod za molekularnu biologiju, Univerzitet Virtual u Pakistanu, Lahore, Pakistan
Faiz M. M. T. Marikar
orcid.org/0000-0003-4579-7263
; Univerzitet General Sir John Kotelawala Defense, Ratmalana, Šri Lanka
Muneeb M. Musthafa
; Zavod za biosistemsku tehnologiju, Tehnološki fakultet, Jugoistočni Univerzitet u Šri Lanki, Univerzitetski park, Oluvil, Šri Lanka
Kamran Abbas
; Zavod za molekularnu biologiju, Univerzitet Virtual u Pakistanu, Lahore, Pakistan
Akhtar Ali
; Zavod za molekularnu biologiju, Univerzitet Virtual u Pakistanu, Lahore, Pakistan
Masroor E. Babar
; Zavod za molekularnu biologiju, Univerzitet Virtual u Pakistanu, Lahore, Pakistan
Abstract
Mitohondrijske DNK sekvence DNK-D petlji (mtDNK) 105 jedinki (11 ratalpuri sojeva beetal koze i 94 sekvence iz GenBank) od 19 geografskih i fenotipičnih domaćih pasmina koza u Pakistanu rabljeno je u ovom eksperimentu. U ovoj smo studiji istražili varijabilnost i njezinu molekularnu filogeniju. Zamijećen je ukupno 81 različit haplotip u 105 jedinki s raznolikošću haplotipova 0,984±0,006 i nukleotidnom raznolikošću 0,03953±0,00843. Filogenetskom analizom ustvrđen iz mtDNK hipervarijabilni segment (HVI) kontrolnog područja (481 bp) i pokazala je četiri haploskupine mtDNK (A, B1, C i D) identificirane u pakistanskih domaćih koza, u kojima se haploskupina A (84,11 %) pokazala dominantnom i široko rasprostranjenom među svim istraživanim pasminama. Studija je otkrila da svi haplotipovi rajanpuri soja pripadaju haploskupini A. Rajanpuri je rijedak lokalni soj beetal pasmine koza smješten u zapadnoj regiji provincije Punjab u Pakistanu. Rezultati genetske raznolikosti na temelju 11 mikrosatelitnih lokusa otkrili su alelnu raznolikost (3,6363) i visoku genetsku raznolikost (0,8342) istraživane rajanpuri pasmine koza. Rezultati analize za potpis za događaje uskog grla uporabom tri modela otkrili su značajno odstupanje rajanpuri koza od ravnoteže mutacija i pomaka. Kvalitativni test analize modalnog pomaka podržao je i rezultate dobivene trima modelima, ukazujući na prisutnost genetskog uskog grla u rajanpuri soja u nedavnoj prošlosti. Ova studija po prvi put pruža informacije o arhitekturi mtDNK, genetskoj raznolikosti, analizi uskog grla koje će biti korisne u donošenju odluke o očuvanju i upravljanju cijenjenom i skupocjenom rajanpuri kozom.
Keywords
mtDNK D-petlja; filogenetska analiza; mikrosatelitni marker; analiza uskog grla; rajanpuri koza; Pakistan
Hrčak ID:
248800
URI
Publication date:
1.2.2021.
Visits: 1.707 *