Professional paper

DNA barkodiranje kao alat za identifikaciju karantenskih vrsta kukaca

Ivana Križanac orcid.org/0000-0001-9185-8341 ; Croatian Agency for Agriculture and Food, Centre for Plant Protection Zagreb *
Maja Pintar ; Croatian Agency for Agriculture and Food, Centre for Plant Protection Zagreb
Mladen Šimala ; Croatian Agency for Agriculture and Food, Centre for Plant Protection Zagreb
Andrijana Novak ; Croatian Agency for Agriculture and Food, Centre for Plant Protection Zagreb

* Corresponding author.

Abstract

Broj prioritetnih i reguliranih vrsta štetnika na karantenskim listama Europske unije sve je veći. Specijalisti dijagnostičari, posebice entomolozi, susreću se s novim vrstama, ali i razvojnim stadijima (ličinke ili jaja) za koje je precizna identifikacija na temelju morfoloških obilježja nemoguća. Molekularna dijagnostika pruža potporu u identifikaciji vrsta karantenskih štetnih organizama i drugih invazivnih vrsta. DNA barkodiranje metoda je kojom se organizmi mogu precizno identificirati na temelju slijeda nukleotida (sekvencija) u odabranom genu ili genima. Već duže se koristi kao alat za identifikaciju vrsta više skupina životinja, biljaka i mikroorganizama. Za identifikaciju vrsta kukaca kao standardni „barkod“ najčešće se koristi fragment 5' regije mitohondrijskog gena za podjedinicu I citokrom c oksidaze (COI). Slijed nukleotida u ciljanom fragmentu DNA (DNA sekvencija) uspoređuje se s DNA sekvencijama iz referentnih baza podataka.

Keywords

molekularna dijagnostika; DNA sekvencija; COI; identifikacija vrste; nedestruktivna ekstrakcija DNA; invazivne vrste

Hrčak ID:

321629

URI

https://hrcak.srce.hr/321629

Publication date:

13.9.2024.

Visits: 92 *