Croatica Chemica Acta, Vol. 78 No. 4, 2005.
Original scientific paper
Kemometričko proučavanje i molekularno modeliranje derivata 1H-indol-3-octene kiseline s auksinskom aktivnošću
Rudolf Kiralj
Márcia M. C. Ferreira
Abstract
Proučavanje kvantitativnih relacija izme|u strukture i auksinske aktivnosti za 22 derivata 1H-indol-3-octene kiseline sprovedeno je pomoću analize glavnih komponenata (PCA), hijerarhijske grozdaste analize (HCA), regresije parcijalnih najmanjih kvadrata (PLS) i višestruke linearne regresije (MLR). Molekularna geometrija auksina optimizirana je na razini MMFF94 i ab initio B3LYP 6-31G** teorije. Izvršeno je i modeliranje kompleksa nekih auksinskih molekula i auksinskoga proteina 1 (ABP1). Zadovoljavajući modeli PLS i MLR za predvi|anje optimalne i polu-optimalne auksinske koncentracije za produljenje koleoptila Avena L. Sativa dobiveni su pomoću test-skupova s 15 auksina. Analize podataka HCA i PCA za polu-optimalnu koncentraciju klasificirale su auksine s obzirom na vrstu i mjesto supstitucije, biološku aktivnost i veličinu d`epova u aktivnom mjestu proteina ABP1. Molekularna grafika kompleksa ABP1–NAA derivati kao i koordinacijskih sfera oko vodikovih atoma u NAA (1-naftalenska kiselina) dobro se sla`e s kemometričkim i QSAR rezultatima.
Keywords
Hrčak ID:
2542
URI
Publication date:
20.12.2005.
Visits: 2.041 *