Original scientific paper
https://doi.org/10.15255/KUI.2023.013
Procjena afiniteta vezanja DNA ksantenskih spojeva: in vitro i in silico pristup
Elma Veljović
orcid.org/0000-0003-1129-1491
; University of Sarajevo-Faculty of Pharmacy, Zmaja od Bosne 8, 71 000 Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
Amar Osmanović
orcid.org/0000-0002-4206-6177
; University of Sarajevo-Faculty of Pharmacy, Zmaja od Bosne 8, 71 000 Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
Mirsada Salihović
orcid.org/0000-0001-7497-4084
; University of Sarajevo-Faculty of Pharmacy, Zmaja od Bosne 8, 71 000 Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
Nevzeta Ljubijankić
; University of Sarajevo-Faculty of Science, Zmaja od Bosne 33-35, Sarajevo 71 000, Bosnia and Herzegovina
Sabina Begić
orcid.org/0000-0002-3523-8268
; University of Sarajevo-Faculty of Science, Zmaja od Bosne 33-35, Sarajevo 71 000, Bosnia and Herzegovina
Selma Špirtović-Halilović
; University of Sarajevo-Faculty of Pharmacy, Zmaja od Bosne 8, 71 000 Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
Abstract
Derivati ksantena važna su klasa heterocikličkih spojeva sa širokim spektrom farmakoloških aktivnosti. U našim prethodnim istraživanjima pronašli smo dobru antiproliferativnu aktivnost dvaju derivata ksantena, s minimalnom toksičnošću ispitanom in vitro testovima. U ovoj smo studiji testirali interakciju spoja 1 (snažan antiproliferativni spoj) s DNA telećeg timusa (CT-DNA) u fiziološkim uvjetima spektrofotometrijskom titracijom. Predviđanje vezanja i vrsta interakcijskih sila uključenih u raspored između derivata ksantena i CT-DNA također su istraženi kroz studije molekularnog spajanja.
Rezultati su pokazali da spoj 1 stupa u interakciju s CT-DNA grove vezanjem. Nađeno je da konstanta vezanja iznosi 2,5 ∙ 104 M–1 i ukazuje na nekovalentno vezanje spoja 1 na CT-DNA. Rezultati docking studije predstavljaju moguće načine vezanja, s energijama vezanja od −9,39 odnosno −8,65 kcal mol–1 za spojeve 1 i 2, što je u skladu s prethodno dobivenim in vitro rezultatima za antiproliferativno djelovanje.
Uz eksperimentalno istraživanje, izračun teorije funkcionalne gustoće (DFT) s razinama teorija B3LYP/6-31G*, B3LYP/6-31G** i B3LYP/6-31+G* proveden je na spojevima 1 i 2 da bi se dobila optimizirana geometrija, spektroskopska i elektronička svojstva.
Ove studije mogle bi pomoći u razumijevanju mehanizama toksičnosti, otpornosti, nuspojava derivata ksantena i njihovog mehanizma djelovanja na DNA.
Keywords
DNA vezanje; docking; DFT; ksanten
Hrčak ID:
309708
URI
Publication date:
11.11.2023.
Visits: 146 *