Original scientific paper

Preciznost sklapanja genoma bakterije Escherichia coli nakon γ-zračenja

Jelena Repar ; Department of Molecular Biology, Ruđer Bošković Institute, Bijenička 54, HR-10000 Zagreb, Croatia
Davor Zahradka ; Department of Molecular Biology, Ruđer Bošković Institute, Bijenička 54, HR-10000 Zagreb, Croatia
Ksenija Zahradka ; Department of Molecular Biology, Ruđer Bošković Institute, Bijenička 54, HR-10000 Zagreb, Croatia

Abstract

Gama-zračenje je moćan agens koji oštećuje molekulu DNA i uzrokuje preraspodjelu genoma. U ovom smo radu ispitali sposobnost bakterije Escherichia coli da precizno sklopi svoj genom nakon višestrukih dvolančanih lomova DNA izazvanih γ-zračenjem. Nedavno smo dokazali da izuzetno velike doze γ-zračenja ili nedostatak proteina RecA uzrokuju pogrešno sklapanje genoma u bakteriji Deinococcus radiodurans, otpornoj na zračenje. Stoga smo istražili preciznost sklapanja genoma u divljem tipu i mutantu recA bakterije E. coli nakon izlaganja dozama γ-zračenja što smanjuju mogućnost preživljavanja stanica 10^6 do 10^7 puta. Kod 38 % stanica divljega tipa došlo je do velikih promjena u genomu, uglavnom kao posljedica izrezivanja profaga e14. Uz to, pronašli smo još samo jedan tip veće promjene u preraspodjeli genoma koji je vjerojatno posljedica udvostručenja fragmenta DNA. Rezultati pokazuju da divlji tip bakterije E. coli ima neočekivano veliku preciznost obnove genoma. U mutantima recA recBCD i recA recBCD sbcB nismo detektirali preraspodjelu genoma, što pokazuje da bi i RecA-neovisni popravak DNA u bakteriji E. coli također mogao biti vrlo precizan.

Keywords

Escherichia coli; popravak DNA; dvolančani lomovi DNA; preraspodjela genoma; γ-zračenje; mutanti recA

Hrčak ID:

109131

URI

https://hrcak.srce.hr/109131

Publication date:

9.9.2013.

Article data in other languages: english

Visits: 1.437 *