Veterinarski arhiv, Vol. 81 No. 3, 2011.
Izvorni znanstveni članak
Karakterizacija rotavirusa izdvojenih iz bivola, peradi i čovjeka u Zapadnoj Indiji.
Ganesh S. Niture
; Department of Animal Biotechnology, College of Veterinary and Animal Sciences, Parbhani, M.S. India
Aviansh G. Karpe
; KNP College of Veterinary and Animal Sciences, Shirwal, Maharashtra State, India
Minakshi Prasad
; Department of Animal Biotechnology, College of Veterinary Sciences, Lala Lajpat Rai University of Veterinary and Animal Sciences (Erstwhile CCS HAU), Hisar, Haryana, India
Sažetak
Istraživani su rotavirusa u bivola, peradi i čovjeka. Ukupno su na prisutnost rotavirusa bila pretražena 83 uzorka fecesa bivola, 54 peradi i 81 uzorak stolice čovjeka probirnim RNA-PAGE testom, od čega je pozitivnih bilo šest (12,5%) uzoraka bivola, četiri (7,84%) uzorka peradi i 16 (20,25%) uzoraka stolice čovjeka. Svi bivolji i ljudski uzorci rotavirusa pozitivni poliakrilamid gel elektroforezom pokazivali su profil RNA segmenata karakterističan za skupinu A rotavirusa (4:2:3:2), dok su uzorci karakteristični za rotaviruse skupine D (5:2:2:2) bili dokazani u peradi. Svi pozitivni uzorci iz bivola (23,07%) pokazivali su dugi elekroferotip, dok je kratak elekroferotip ustanovljen u uzorcima peradi (15,38%). Većina (60%) ljudskih uzoraka rotavirusa imala je dugi elektroferotip, a preostalih 40% kratki. Ukupno je 10 različitih elektroferotipova bilo dokazano u trima pretraživanima domaćinima od čega su četiri pripadala bivolu, jedan peradi i pet čovjeku, a jedan uzorak iz čovjeka dokazan je kod mješovite infekcije. Prisutnost rotavirusa u RNA-PAGE pozitivnim uzorcima bila je dodatno potvrđena RT-PCR-om specifičnim za gene VP4 i VP7. Djelomično umnožen odsječak gena za VP4 bivoljih rotavirusa sadržavao je 856 bp, a ljudskih rotavirusa 876 bp. Proizvod gena za VP7 i bivoljih i ljudskih rotavirusa sadržavao je 1062 bp. Genotipizacijom G RT-PCR-om pozitivnih uzoraka ni u jednom uzorku nije bio dokazan proizvod specifičan za ikoji od tipova G6, G8 i G10. Genotipizacijom P istih uzoraka ustanovljen je genotip P[11] samo u dvjema (33,33%) uzorcima bivola. Šest ljudskih rotavirusa (37,5%) bilo je tipizirano kao genotip G[1], ali se nisu mogli tipizirati na osnovi genotipa P. Geni za VP4 i VP7 ptičjih rotavirusa nisu se mogli umnožiti. Međutim gen za VP6 svih ptičjih rotavirusa dao je fragment od 493 bp. Ovo je prvi dokaz skupine D rotavirusa u Zapadnoj Indiji.
Ključne riječi
rotavirusi; bivol; perad; čovjek; Zapadna Indija
Hrčak ID:
69412
URI
Datum izdavanja:
20.6.2011.
Posjeta: 1.123 *