Izvorni znanstveni članak

Usporedna procjena različitih postupaka lančane reakcije polimerazom uz prethodnu reverznu transkripciju za dokaz gena F i N virusa kuge malih preživača u kliničkim uzorcima.

Sumit Mahajan ; Division of Veterinary Epidemiology and Preventive Medicine, SKUAST-Jammu, J&K, India
Rajesh Agrawal ; Division of Veterinary Epidemiology and Preventive Medicine, SKUAST-Jammu, J&K, India
Mahesh Kumar ; Department of Epidemiology and Preventive Medicine, GBPUA&T, Pantnagar, Uttrakhand, India
Anand Mohan ; Department of Epidemiology and Preventive Medicine, GBPUA&T, Pantnagar, Uttrakhand, India
Nishi Pande ; Division of Animal Reproduction Gynecology and Obstetrics, SKUAST-Jammu, J&K, India

Sažetak

Istražena je dijagnostička vrijednost različitih početnica za gene F i N koje se sada rabe za dijagnosticiranje kuge malih preživača lančanom reakcijom polimerazom uz prethodnu reverznu transkripciju u usporedbi sa sendvič imunoenzimnim testom (S-ELISA). Testirano je ukupno pet parova početnica: dva para (F1/F2 i Fb1/Fb2) specifična za različita područja gena F i tri para specifična za različita područja gena N (NP3/NP4, pprn_fr2/pprn_rev i N1/N2). Njihova vrijednost bila je uspoređena pretragom 10 kliničkih uzoraka (četiri uzorka krvi, četiri uzorka nosnog obriska i dva uzorka tkiva) uzetih od životinja pod sumnjom na kugu malih preživača. Uporabom početnica NP3/NP4 dokazan je najveći broj pozitivnih uzoraka (6/10), a potom početnicom N1/N2 (5/10). Objema početnicama za gen F (F1/F2 i Fb1/Fb2) dokazana su tri pozitivna uzorka (3/10). Par početnice pprn_fr2/pprn_rev nije dao željeni umnožak (amplikon) ni u jednom pretraženom uzorku. Osjetljivost i specifičnost od 100% dokazana je za početnice NP3 i NP4, dok pprn_fr2/pprn_rev nisu pokazale nikakvu reakciju te njihovom upotrebom nije dokazan nijedan pozitivan uzorak. Podudarnost od 100% s kappa vrijednošću 1,00 bila je najveća između S-ELISA-e te RT-lančane reakcije polimerazom upotrebom početnica NP3 i NP4 što govori o posvemašnjoj podudarnosti, dok je na drugom mjestu po podudarnosti bila početnica N1/N2 s kappa vrijednošću od 0,800. Rezultati pokazuju da se RT-lančana reakcije polimerazom upotrebom početnica za gen F može zamijeniti vrlo osjetljivom i specifičnom reakcijom uz upotrebu početnica za gen N za dokazivanje nukleinske kiseline virusa kuge malih preživača.

Ključne riječi

molekularni dokaz; kuga malih preživača; lančana reakcija polimerazom s prethodnom reverznom transkripcijom

Hrčak ID:

128427

URI

https://hrcak.srce.hr/128427

Datum izdavanja:

10.10.2014.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 1.235 *