Veterinarski arhiv, Vol. 86 No. 1, 2016.
Izvorni znanstveni članak
Filogenetsko istraživanje djelomičnih sekvencija gena G terenskih izolata virusa bjesnoće u Litvi.
Dainius Zienius
; Lithuanian University of Health Sciences, Institute of Microbiology and Virology, Kaunas, Lithuania
Gediminas Pridotkas
; National Food and Veterinary Risk Assessment Institute, Vilnius, Lithuania
Mindaugas Morkūnas
; National Food and Veterinary Risk Assessment Institute, Vilnius, Lithuania
Modestas Ružauskas
; Lithuanian University of Health Sciences, Institute of Microbiology and Virology, Kaunas, Lithuania
Sažetak
Svrha ovog rada bila je odrediti molekularnu epidemiologiju djelomičnih sekvencija gena G virusa bjesnoće u terenskim uzorcima pozitivnima na bjesnoću iz različitih područja Litve te ih filogenetski usporediti s različitim izolatima virusa bjesnoće iz divljih mesojeda na području Baltičkog jezera, Europe i Rusije. Pretraženo je 20 uzoraka tkiva mozga bijesnih životinja prikupljenih u razdoblju od 2006. do 2011. Višestruka poravnanja sekvencija od 358 nukleotida gena G (nt 3324-3682) učinjena su pomoću programa ClustalW. Filogenetska i molekularno evolucijska analiza provedena je metodom združivanja genetski najsličnijih sojeva (engl. Neighbour-joining method) u MEGA verziji 4. Filogenetska istraživanja glikoproteina virusa naznačuju da su G-sekvencije izolata litavskoga virusa bjesnoće usko srodne i pokazuju 89,8-98,9 % nt identičnosti. G-sekvencije izolata virusa bjesnoće iz litavskog rakunskog psa i crvenih lisica bile su sačuvanije (97,2 % nt identičnosti) nego izolati virusa bjesnoće izdvojeni iz rakunskog psa (95,1 % nt identičnosti). G-sekvencije dvaju izolata iz litavskih rakunskih pasa bile su prilično divergentne (90,8 i 91,2 % nt identičnosti) i usko srodne s G-sekvencijama izolata virusa bjesnoće iz Estonije (92,5 % nt identičnosti), Rusije (91,0 %) i Poljske (89,3 %). Komparativno istraživanje G-sekvencije litavskih izolata virusa bjesnoće i različitih izolata iz Njemačke, Slovenije i Francuske pokazalo je 84,2 % nt identičnosti, dok je identičnost između G-sekvencije između litavskih izolata virusa bjesnoće i ruskih izolata bila na razini 88,1 % nt identičnosti.
Ključne riječi
bjesnoća; rakunski pas; crvena lisica; Baltik; molekularna epidemiologija
Hrčak ID:
153490
URI
Datum izdavanja:
15.2.2016.
Posjeta: 983 *