Izvorni znanstveni članak

https://doi.org/10.5513/JCEA01/17.3.1767

Analýza polymorfizmu miRNA vo vybraných vývojových štádiách ľanu siateho

Lucia HLAVAČKOVÁ ; Slovak University of Agriculture, Faculty of Agrobiology and Food Resources, Department ofGenetics and Plant Breeding, Tr. A. Hlinku 2, 949 76 Nitra, Slovak Republic
Janka NÔŽKOVÁ ; Slovak University of Agriculture, Faculty of Agrobiology and Food Resources, Department ofGenetics and Plant Breeding, Tr. A. Hlinku 2, 949 76 Nitra, Slovak Republic
Elizaveta POROKHOVINOVA ; N. I. Vavilov Institute of Plant Genetic Resources, 42-44, B. Morskaya Street,190000, St. Petersburg,Russia
Nina BRUTCH ; N. I. Vavilov Institute of Plant Genetic Resources, 42-44, B. Morskaya Street,190000, St. Petersburg,Russia
Tatiana SHELENGA ; N. I. Vavilov Institute of Plant Genetic Resources, 42-44, B. Morskaya Street,190000, St. Petersburg,Russia
Marie BJELKOVÁ ; AGRITEC, Research, Breeding and Services, Ltd., Zemědělská 2520/16, 787 01 Šumperk, CzechRepublic
Katarína RAŽNÁ ; Slovak University of Agriculture, Faculty of Agrobiology and Food Resources, Department ofGenetics and Plant Breeding, Tr. A. Hlinku 2, 949 76 Nitra, Slovak Republic

Sažetak

MikroRNA sú malé nekódujúce molekuly RNA, ktoré majú dôležitú úlohu pri regulácii génovej expresie v podmienkach vplyvu rôznych biotických a abiotických faktorov stresu, ako aj v rámci rôznych vývojových štádii rastlín. Sú súčasťou mnohých biologických a metabolických procesov rastlín. Výskum bol zameraný na potenciál vybraných typov mikroRNA (miR156 a miR168), ako molekulárnych markérov pre účely mapovania polymorfizmu genómu ľanu vo vzťahu k určitým vývojovým štádiám (púčik – kvitnutie – tvorba tobolky), ako odraz ich aktivity v daných pletivách a orgánoch ľanu siateho. Polymorfizmus miRNA bol hodnotený na 8 genotypoch ľanu pomocou molekulárnych markérov na báze mikroRNA a údaje boli podporené hodnotením morfologických znakov na púčikoch, okvetných lístkoch a v tvoriacich sa tobolkách. Rozsah PCR amplifikácie fragmentov miRNA bol zaznamenaný v rozmedzí od 40 bp do 200 bp (prajmer miR168a-F/miR-R), alebo 35 bp do 120 bp (prajmer miR156b-F/miR-R). Prajmery na báze miRNA amplifikovali celkovo 196, respektíve 158 miRNA lokusov. Je možné konštatovať, že zastúpenie miR168 lokusov sa zvyšovalo v závislosti na vývojovom štádiu (kvetný púčik, kvitnutie a tvorba tobolky). Celkový profil mir156b lokusov mal stúpajúcu tendenciu od fázy tvorby kvetného púčika až po fázu tvorby tobolky a to takmer vo všetkých genotypoch. V závislosti na genetickom pozadí genotypov, bolo možné identifikovať jedinečné miRNA lokusy v olejných a olejno-priadnych genotypoch v rámci vývojových fáz. Identifikácia jedinečných lokusov bola realizovaná pomocou softvéru GeneTool (Syngene). Zistilo sa, že iba genotyp Bolley Golden sa líši od iných genotypov v oboch typoch analýz (molekulárnych aj morfologických), porovnávaním variability počtu lokusov miR168 v štádiu tvorby púčika s variabilitou znaku, farba lupienkov v púčiku.

Ključne riječi

ľan; mikroRNA; miRNA; morfológia; polymorfizmus; vývojové štádiá

Hrčak ID:

167897

URI

https://hrcak.srce.hr/167897

Datum izdavanja:

5.9.2016.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 981 *