Original scientific paper

https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0192

Povezanost genskih varijanti akvaporina 7 s kvalitetom sjemena u murrah bivola

Ragini Kumari ; Department of Animal Genetics and Breeding, Indian Council of Agricultural Research - National Dairy Research Institute, Karnal, India
Ramesha P. Kerekoppa ; Dairy Production Section, Indian Council of Agricultural Research-National Dairy Research Institute, Southern Regional Station, Bengaluru, India
Rakesh Kumar ; ICAR Research Complex for NEH Region, Umiam, Umroi Road, Meghalaya, India
Divya P ; Central Research Station, BAIF, Pune, India
Beena Sinha ; Department of Animal Genetics and Breeding, Indian Council of Agricultural Research - National Dairy Research Institute, Karnal, India
Marappa Basavaraju ; Dairy Production Section, Indian Council of Agricultural Research-National Dairy Research Institute, Southern Regional Station, Bengaluru, India
Akhila Rao ; Dairy Production Section, Indian Council of Agricultural Research-National Dairy Research Institute, Southern Regional Station, Bengaluru, India

Abstract

Gen akvaporin 7 (AQP7), koji pripada akvagliceroporinima, analiziran je kombinacijom lančane reakcije polimerazom i utvrđivanjem polimorfizma jednolančane konformacije (PCR-SSCP) s ciljem da se istraži povezanost genskih varijanti s kvalitetom sjemena u Murrah bivola. Genomska DNA izdvojena je iz krvi bivola (n = 69) high salt metodom. Za otkrivanje polimorfizma pojedinačnih nukleotida (SNP) sekvencije su analizirane programom Bio Edit (verzija 7.0.5). Statistička analiza provedena je GLM procedurom ponovljenih mjerenja (SAS 9.3). Analiza je pokazala 17 različitih SSCP varijanti AQP7gena u Murrah bivola. Tri jedinstvena SSCP rasporeda linija utvrđena su u egzonima 1 i 4. Egzoni 5, 7 i 8 pokazali su pet, četiri i dva jedinstvena SSCP rasporeda linija. Sekvenciranje je pokazalo ukupno 20 SNP-a (8 u egzonima i 12 u intronima). PCR-SSCP varijante egzona 5 statistički su značajno povezane (P<0,01) s koncentracijom sjemena. SSCP varijante egzona 5 i 8 značajno su povezane (P<0,05) s vijabilnošću spermija i njihovom pokretljivošću nakon odmrzavanja. Istraživanje je pokazalo visok stupanj genetičke varijabilnosti akvaporina 7 u Murrah bivola. Utvrđene SSCP varijante koje su povezane s pokazateljima kakvoće sjemena upućuju na mogućnost upotrebe akvaporina 7 gena kao kandidatnog gena za identifikaciju biljega kvalitete sjemena bivola.

Keywords

gen AQP7; Murrah bivol; PCR-SSCP; SNP

Hrčak ID:

214756

URI

https://hrcak.srce.hr/214756

Publication date:

15.12.2018.

Article data in other languages: english

Visits: 1.089 *