Izvorni znanstveni članak

https://doi.org/10.46419/vs.52.1.6

Polimorfizmi lokusa CAPN, CAST, LEP, GH, GHR, IGF-1 i MSTN u križanaca kreolske dlakave ovce iz Kolumbije s ovcama pelibuey pasmine

Claudia Lenis-Valencia orcid.org/0000-0003-4846-6646 ; Faculty of Agricultural Sciences, National University of Colombia, Colombia
Darwin Hernández-Herrera orcid.org/0000-0002-1758-604X ; Faculty of Agricultural Sciences, National University of Colombia, Colombia
Luz Álvarez-Franco ; Faculty of Agricultural Sciences, National University of Colombia, Colombia

Sažetak

Cilj ove studije bio je okarakterizirati polimorfizam pojedinačnih nukleotida kod Calpaina (CAPN), kalpastatina (CAST), leptina (LEP), hormona rasta (GH), receptora hormona rasta (GHR), inzulinu sličnog čimbenika rasta 1 (IGF-1) i miostatina (MSTN) u križanaca kreolske dlakave ovce iz Kolumbije s ovcama pelibuey pasmine. U 192 jedinke, lokusi CAST i MSTN genotipizirani su PCR-RFLP, a loci CAPN, GH, GHR, IGF-1 i LEP pomoću PCR-SSCP i sekvenci. Izračunati su sljedeći pokazatelji: alelna i genotipska frekvencija, uočena (Ho) i očekivana heterozigotnost (He), indeks fiksacije i odstupanja od ravnoteže Hardy-Weinberga (HWE). U lokusu CAPN nađene su veće frekvencije alela T (70 %) u odnosu na C (30 %), a frekvencije genotipa TT (46 %) i TC (48 %) su nadmašile CC (6 %). Kod CAST-a, MM genotip (83 %) je bio najčešći, a slijede ga ostali genotipovi (MN: 16 % i NN 0,5 %), tako da su alelne frekvencije bile M: 91 % i N: 9%. Alel A (66 %) lokuse LEP bio je češći od alela G (34 %), a AA, AG i GG genotipovi imali su frekvencije 43, 47 i 10 %. U lokusu GH pronađene su samo dva genotipa (AA: 64 % i AG: 36 %) s alelnim frekvencijama 82 i 18 % za A i G. U lokusu IGF-1, genotipovi AA, GG i
AG prikazali su frekvencije od 36, 49 i 15 %, s većom prisutnošću alela G (56 %) od A (44 %). U analiziranoj populaciji, lokusi GHR i MSTN bili su monomorfni, a u svakom su pronađeni samo AA i MM genotipovi. Lokusi CAST, GH i IGF-1 pokazali su odstupanja od HWE.
Jedino je u IGF-1 lokusu ustanovljen manjak He. Lokusi CAPN, CAST, LEP, GH i IGF-1 bili su polimorfni s visokim He i viškom heterozigota. Nasuprot tome, lokusi GHR i MST bili su monomorfni. Rezultati prikazani u ovom istraživanju mogu se koristiti u programima uzgoja životinja.

Ključne riječi

uzgoj životinja; genetska raznolikost; zoogenetski resurs

Hrčak ID:

239427

URI

https://hrcak.srce.hr/239427

Datum izdavanja:

25.11.2020.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 1.261 *