Veterinarski arhiv, Vol. 90 No. 6, 2020.
Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0600
Povezanost između novih SNP-a u egzonu 10 gena receptora hormona rasta i pokazatelja rasta u indijskih pasmina ovaca
Amiya R. Sahu
; Animal Genetics and Breeding, ICAR-Central Coastal Agricultural Research Institute, Goa, India
Veerasamy Jeichitra
; Post Graduate Research Institute in Animal Sciences, Kattupakkam, Kancheepuram, T.N., India
Ramanujam Rajendran
; Post Graduate Research Institute in Animal Sciences, Kattupakkam, Kancheepuram, T.N., India
Angamuthu Raja
; Department of Animal Biotechnology, Madras Veterinary College, T.N., India
Sažetak
Gen receptora hormona rasta (GHR) kodira tip I citokinskog receptora koji pomaže u vezanju hormona rasta na ovaj receptor, promovirajući dimerizaciju receptora i time regulirajući rast. Ovčji gen GHR, lociran na kromosomu 16, sadržava 10 egzona i 9 introna s netranslatirajućim regijama s obje strane, tvoreći ukupnu veličinu od 178,09 kb. Dosadašnja istraživanja pokazala su da se polimorfizam nalazi većinom u egzonu 10, koji je ujedno veći fragment ovoga gena i sadržava 1102 bp. Ovo je istraživanje provedeno kako bi se otkrio polimorfizam u egzonu 10 gena GHR i njegova povezanost s pokazateljima rasta. Genomska DNA izolirana je iz uzoraka krvi ovaca pasmina Madras Red i Mecheri iz Indije. Dio egzona 10 (895 bp) gena GHR je umnožen i poslan na sekvenciranje koje je u obje pasmine ovaca pokazalo tranziciju nukleotida G > A na lokusima G177624A i G177878A. Probir populacija učinjen je pomoću Tetra-primer ARMS-PCR-a. Učestalost genotipa GG bila je 0,276, genotipa GA 0,519, a genotipa AA 0,205 na 177624 G>A, te 0,307, 0,444 i 0,149 na 177878 G>A u pasmine Madras Red. U pasmine Mecheri učestalost genotipa GG bila je 0,476, učestalost genotipa GA 0,372, a genotipa AA 0,152 na 177624 G > A, te 0,629, 0,314 i 0,057 na 177878 G > A. Učestalost alela G i A, koja je bila 0,5355 i 0,4645 na 177624 G > A, te 0,5790 i 0,4210 na 177878 G>A u ovaca Madras Red, dok je u pasmine Mecheri bila 0,6620 i 0,3380 na 177624 G>A, te 0,7860 i 0,2140 na 177878 G>A. Spol je znakovito utjecao na tjelesnu masu pri janjenju te u dobi od 6 i 9 mjeseci, no nije bilo znakovitog utjecaja u dobi od 3 i 12 mjeseci u pasmine Mecheri. S druge strane, u pasmine Madras Red spol je znakovito utjecao na tjelesnu masu u svim fazama rasta osim pri odbiću. Analizirana je povezanost varijacija s tjelesnom masom pri janjenju, odbiću te u dobi od 6, 9 i 12 mjeseci u obje pasmine, koja nije bila znakovita. Budući da su otkrića ovih SNP-a važna u proučavanju gena GHR u indijskih pasmina ovaca, potrebna su daljnja istraživanja njihova učinka koja bi mogla biti korisna u genetskom poboljšanju populaciju primjenom markerima potpomognute selekcije.
Ključne riječi
povezanost; tjelesna masa; genski receptor hormona rasta; izvorne pasmine ovaca; SNP
Hrčak ID:
250285
URI
Datum izdavanja:
22.12.2020.
Posjeta: 647 *