Original scientific paper

https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.1378

Molekularna karakterizacija cjelovite kodirajuće sekvencije gena MBL1 u indijskog vodenog bivola (Bubalus bubalis)

Manali Baghel ; College of Biotechnology, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, DUVASU, Mathura, India
Deepak Sharma ; Department of Animal Genetics and Breeding, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, DUVASU, Mathura, India
Satyendra P. Singh ; Department of Animal Genetics and Breeding, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, DUVASU, Mathura, India
Vijay Pandey ; Department of Veterinary Biochemistry, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, DUVASU, Mathura, India
Avneesh Kumar ; Department of Animal Genetics and Breeding, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, DUVASU, Mathura, India

Abstract

Lektin koji veže manozu (MBL), član je porodice proteina kolektina koja veže veliki broj mikroorganizama i aktivira lektinski put komplementa prirođene imunosti. U različitim vrstama pronađene su brojne mutacije u kodirajućim i nekodirajućim regijama gena MBL1. Za nekoliko je mutacije utvrđeno da utječu na strukturu gena MBL1, što dovodi do snižavanja razine MBL-a i prirođenog poremećaja imunosnog sustava. U ovom je istraživanju provedeno molekularno kloniranje i karakterizacija cjelovitog slijeda gena MBL1 u indijskog vodenog bivola pasmine Murrah. Fragment s ukupno je 951 bp gena MBL1 umnožen je kloniran i sekvenciran. Višestruko poravnanje sekvencija s drugim pasminama bivola i goveda otkrilo je da je kodirajuća sekvencija gena MBL1 bila 98,1 – 99,6 % podudarna s drugim pasminama bivola i 98,3 – 98,5 % podudarna s drugim pasminama goveda na nukleotidnoj razini. Na razini aminokiselina ustanovljena je podudarnost od 96,8 do 98,8 % s pasminama bivola i 96,8 – 97,2 % s pasminama goveda. Sekvencija aminokiselina MBL1 u vodenih bivola pasmine Murrah sadržavala je dvije nepodudarne supstitucije aminokiselina (L204P i S180P). Osim toga proveden je PCR-RFLP kako bi se 50 bivola pasmine Murrah analiziralo na prisutnost jednonukleotidnih polimorfizama (SNP), g. 855G > A u intronu I i g. 2686T > C, kao i g. 2651G > A, u eksonu 2 regije gena MBL1. Test ApaI/intron I PCR-RFLP otkrio je polimorfni obrazac s tri genotipa: AG (90 %), GG (8 %) i AA (2 %) s učestalošću alela od 0,94 za G i 0,06 za A. Test HaeIII/exon 2 PCR-RFLP pokazao je prisutnost triju genotipova: TC (66 %), TT (32 %) i CC (2 %) s učestalošću alela od 0,15 za T i 0,85 za C. Test StyI/exon 2 PCR-RFLP pokazao je monomorfni obrazac za g. 2651G > A, samo s genotipom GG. Osim navedenog istražena je i povezanost SNP-ova s proizvodnim svojstvima mlijeka i omjerom somatskih stanica (SCS). Nije pronađena znakovita razlika ni za jedno svojstvo. S obzirom na to da se ovo istraživanje temelji na malom broju uzoraka, potrebna su istraživanja koja će uključiti veći broj životinja kako bi se provjerili učinci polimorfizama.

Keywords

vodeni bivol (Bubalus bubalis); gen MBL1; kloniranje; karakterizacija; PCR-RFLP; genetski polimorfizam

Hrčak ID:

305596

URI

https://hrcak.srce.hr/305596

Publication date:

25.6.2023.

Article data in other languages: english

Visits: 165 *