Veterinary Archives, Vol. 93 No. 2, 2023.
Original scientific paper
https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.1873
Prevalencija i molekularna karakterizacija cirkovirusa, astrovirusa i hepadnavirusa u avifauni parka prirode Kopački rit, Hrvatska
Vlatko Rožac
orcid.org/0009-0004-8112-9216
; Kopački Rit Nature Park, Lug, Croatia
Marina Biđin
; Department of Poultry Diseases with Clinic, Faculty of Veterinary Medicine, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Marina Tišljar
orcid.org/0000-0002-9931-2842
; Poultry Centre, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Zdenko Biđin
; Department of Poultry Diseases with Clinic, Faculty of Veterinary Medicine, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Vladimir Savić
orcid.org/0000-0003-0398-5346
; Poultry Centre, Croatian Veterinary Institute, Zagreb, Croatia
Abstract
Iako divlje ptice nose brojne viruse, istraživanja su uglavnom usmjerena na viruse koji posjeduju zoonotski potencijal ili uzrokuju znatne ekonomske gubitke u peradi, dok ostali, poput astrovirusa (AstV), cirkovirusa (CV) i hepadnavirusa (HBV), ostaju zanemareni. U ovom je istraživanju 35 uginulih divljih ptica, koje pripadaju najmanje 21 vrsti iz pet redova prikupljenih u Parku prirode Kopački rit, testirano na prisutnost AstV-a, CV-a i HBV-a PCR-om uz naknadno nukleotidno sekvenciranje. Pozitivan je rezultat ustanovljen u 18 ptica. AstV je pronađen u tri vrapčarke, CV je otkriven u 11 ptica koje pripadaju redovima Accipitriformes, Anseriformes, Charadriiformes, Passeriformes ili Piciformes dok je HBV pronađen u četiri ptice koje pripadaju rodovima Anseriformes ili Passeriformes. Više od jednog virusa pronađeno je u samo u jednoj vrsti (AstV i CV), iako u dvije zasebne ptice. Filogenetska analiza otkrila je divergentni AstV donekle sličan različitim neklasificiranim astrovirusima otkrivenima u neodređenim vrstama ptica. Jedan AstV dijeli najveću sličnost s AstV-om šišmiša (98,77 %). Svi cirkovirusi pronađeni u istraživanju nalikuju na ptičji CV, ali ni jedan od njih ne grupira se u filogenetskom stablu s bilo kojom sličnom sekvencijom. Sve četiri sekvencije HBV-a otkrivene u ovom istraživanju grupiraju se unutar skupine pačjih hepadnavirusa, što upućuje na neuobičajen prijenos na kohabitirajuće vrapčarke. Rezultati ovog istraživanja važan su doprinos spoznajama o prevalenciji, ekologiji i epidemiologiji AstV-a, CV-a i HBV-a u različitim vrstama divljih ptica, što upućuje na potrebu daljnjih istraživanja, uključujući sekvenciranje cijeloga genoma otkrivenih virusa.
Keywords
divlje ptice; astrovirusi; circovirusi; hepadnavirusi
Hrčak ID:
305649
URI
Publication date:
25.6.2023.
Visits: 184 *