Veterinarski arhiv, Vol. 93 No. 4, 2023.
Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.2123
Razvoj kvantitativnog PCR testa temeljenog na SYBR Green I za identifikaciju cirkovirusa svinja 1, 2 i 3
Chang Liu
; Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences, China
Yao Tian
; Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences, China; College of Veterinary Medicine, Qingdao Agricultural University, China
Li-mei Zheng
; College of Veterinary Medicine, Qingdao Agricultural University, China
Ying-Ru Ma
; College of Veterinary Medicine, Qingdao Agricultural University, China
Jian-Li Shi
; Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences, China
Chen Li
; Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences, China; College of Veterinary Medicine, Qingdao Agricultural University, China
Shao-Jian Xu
; Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences, China
Xiao-Yan Wu
; Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences, China
Hong Han
; College of Veterinary Medicine, Qingdao Agricultural University, China
Jun Li
; Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences, China
Xian-Jie Han
; Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences, China
Sažetak
Među cirkovirusima svinja razlikujemo cirkovirus svinja tipa 1 (PCV1), cirkovirus svinja tipa 2 (PCV2) i cirkovirus svinja tipa 3 (PCV3). Posljednjih se godina pojavljuje koinfekcija ovim trima serotipovima, stoga je potrebno uspostaviti brzu, specifičnu i osjetljivu metodu kako bi se kvantitativnim PCR testom temeljenom na SYBR Green I mogli identificirati PCV1, PCV2 i PCV3. U ovom su istraživanju upotrijebljene specifične početnice te su optimizirani uvjeti rekacije za uspostavljanje kvantitativnog PCR-a u stvarnom vremenu. Rezultati su pokazali da su granice detekcije ovog testa 40,3 kopije/μL za PCV1, 25,2 kopije/μL za PCV2 i 22,4 kopije/μL za PCV3. Nije bilo križne reaktivnosti s virusom svinjske kuge (CSFV), virusom reproduktivnog i respiratornog sindroma svinja (PRRSV), virusom pseudobjesnoće svinja (PRV) i parvovirusom svinja (PPV). Koeficijenti varijacije unutar testa i među testovima bili su manji od 1 %. Rezultati analize 100 uzoraka sa sumnjom na PCV pokazali su da je stopa infekcije serotipom PCV1 bila 10% (10/100), PCV2 64% (64/100), a PCV3 52% (52/100). Stopa koinfekcije serotipovima PCV1 i PCV2 bila je 8% (8/100), PCV1 i PCV3 7% (7/100), a PCV2 i PCV3 26% (26/100). Koinfekcija svim trima serotipovima, PCV1, PCV2 i PCV3, bila je 7% (7/100). Metoda primjenjena u ovom istraživanju ima dobru specifičnost, osjetljivost i postojanost te je obećavajući alat za brzo otkrivanje serotipova PCV1, PCV2 i PCV3.
Ključne riječi
cirkovirus svinja; specifičnost; osjetljivost; kvantitativni PCR test temeljen na SYBR Green I; metoda jednostruke identifikacije
Hrčak ID:
308824
URI
Datum izdavanja:
15.9.2023.
Posjeta: 159 *