Veterinarski arhiv, Vol. 81 No. 1, 2011.
Izvorni znanstveni članak
Identifikacija podtipova protozoona Trypanosoma vivax izdvojenih iz goveda i koza pomoću mikrosatelitskih markera.
Savino Biryomumaisho
; Department of Veterinary Medicine, Makerere University, Kampala, Uganda
Eli Katunguka-Rwakishaya
; Department of Veterinary Medicine, Makerere University, Kampala, Uganda
George W. Lubega
; Department of Veterinary Parasitology and Microbiology, Makerere University, Kampala, Uganda
Sara E. Melville
; Department of Pathology, University of Cambridge, Cambridge, CB2 1QP, United Kingdom
Sažetak
Polimorfizam mikrosatelitske DNA može se rabiti za procjenu unutarvrsne genetske raznolikosti pa tako i za karakterizaciju vrsta i sojeva tripanosoma. Prikazana su četiri nova mikrosatelitska markera specifična za vrstu T. vivax izdvojenu iz goveda i koza u Ugandi. GenDB kratka i specifična sekvencija T. vivax dostupna nakon 1. kolovoza 2005. bila je ciljano rabljena za određivanje genomskoga slijeda za protozoon T. vivax koji nije pokazivao križne reakcije s drugim tripanosomama zaraznima za stoku. Izabrani su bili samo di-, tri-, tetrai pentanukleotidni mikrosateliti. Premda se činilo da pentanukleotidne ponavljajuće sekvencije u probirnom testu imaju potrebnu varijabilnost, one su dale lošije PCR proizvode u odnosu na di-, tri- i tetranukleotidne ponavljajuće sekvencije. Mononukleotidne ponavljajuće sekvencije nisu dale jasno vidljive trake na agaroznom gelu pa nisu bile dalje istražene. Jasan polimorfizam postignut je upotrebom gvanina, timina i adenina sa šesnaesterostrukim ponavljanjem (GTA)16 dok je sekvencija citozin, adenin, citozin i timin (CACT)15 bila varijabilna u odnosu na veličinu i dužinu. Sekvencije slične veličine bile su dobivene od mikrosatelita koji su sadržavali timin i adenin (TTA)24, a one od 150 parova baza te 180 - 200 parova baza od mikrosatelita citozina i adenina (CA)26. Ovi nalazi govore u prilog postojanju različitih podtipova protozoona T. vivax u Ugandi, koji bi se mogli odlikovati i različitom virulencijom kao što je dokazano za podtipove T. congolense.
Ključne riječi
mikrosateliti; Trypanosoma vivax; podtipovi
Hrčak ID:
66434
URI
Datum izdavanja:
21.2.2011.
Posjeta: 1.242 *