Original scientific paper

https://doi.org/10.1515/aiht-2015-66-2631

Modeliranje vezivanja bakra(II) za pentapeptide povezane s atrijalnim natriuretičkim faktorom pomoću indeksa povezanosti 3χv

Ante Miličević ; Institute for Medical Research and Occupational Health, Zagreb, Croatia
Nenad Raos ; Institute for Medical Research and Occupational Health, Zagreb, Croatia

Abstract

Služeći se teorijom molekularnih grafova istraživali smo vezivanje NSFRY-NH2 i 12 srodnih pentapetidnih amida za Cu(II) kao modelnog sustava za interakciju bakra s peptidnom molekulom atrijalnog natriuretičkog faktora (ANF). Modeli linarne regresije temeljeni na valencijskom indeksu povezanosti trećega reda (3χv) reproducirali su eksperimentalnu konstantu stabilnosti (log β) za komplekse koordinacije 1N, 2N, 3N i 4N sa standardnom pogreškom u rasponu od 0,30 do 0,39 log β jedinica. Razvili smo odvojene modele za sedam tirozinskih (N=28) i pet netirozinskih (N=20) peptida te skupni model s indikatorskom varijablom za obje vrste peptida (N=48). Rezultati upućuju na dodatnu aromatsku stabilizaciju u kompleksima vrste 4N zbog interakcija kationa s π-orbitalama tirozinskog ostatka, ali ne i fenilalaninskoga. Ispravili smo i pogrešne vrijednosti log K i log K* nastale omaškom u radu Anne Janicka-Klos i sur. 2013.

Keywords

kompleksni spojevi; peptidi; konstante stabilnosti; topološki indeksi

Hrčak ID:

139894

URI

https://hrcak.srce.hr/139894

Publication date:

16.6.2015.

Article data in other languages: english

Visits: 1.087 *