Original scientific paper

Molekularna karakterizacija gena za mitohondrijsku 16S rRNA goveda, bivola i jaka.

Deep P. Saikia ; Department of Animal Biotechnology, CVSc, AAU, Guwahati, Assam, India
Dhruba J. Kalita ; Department of Veterinary Biochemistry, CVSc, AAU, Guwahati, Assam, India
Probodh Borah ; Department of Animal Biotechnology, CVSc, AAU, Guwahati, Assam, India
Satya Sarma ; Department of Veterinary Biochemistry, CVSc, AAU, Guwahati, Assam, India
Rupam Dutta ; Department of Animal Biotechnology, CVSc, AAU, Guwahati, Assam, India
Deekshita Rajkhowa ; Department of Veterinary Biochemistry, CVSc, AAU, Guwahati, Assam, India

Abstract

Kombinacija lančane reakcije polimerazom (PCR) s polimorfizmom duljine restrikcijskih fragmenata (RFLP) i utvrđivanjem slijeda nukleotida (sekvenciranje) najpoželjniji je i učinkovit postupak za otkrivanje širokog raspona varijacija pri karakterizaciji različitih vrsta. Cilj ovog istraživanja bio je razviti molekularni otisak za gen koji određuje mitohondrijske 16S rRNA goveda, bivola i jaka. Za izdvajanje mitohondrijske DNA nasumično je prikupljeno po 10 uzoraka krvi različitih životinja unutar svake vrste. Izdvojena DNA iskorištena je za umnažanje 16S rRNA gena uz uporabu univerzalnih početnica. Veličina umnoženih proizvoda iznosila je 600 bp. RFLP analize provedene su digestijom amplikona pomoću restrikcijskih enzima viz. AluI, HinfI i HaeIII. Dobiveni RFLP uzorak mogao je lako prepoznati i razlikovati svaku od vrsta. Sekvenciranje amplikona u sve tri vrste provedeno je s ciljem da se potvrde varijacija na razini nukleotida. Analiza sekvencija pomoću računalnog programa MEGA4 i metoda PCR-RFLP pokazala je da se gen 16S rRNA može upotrijebiti kao dobar kandidat za molekularni biljeg.

Keywords

PCR-RFLP; mitohondrijske DNA; sekvenciranje; 16S rRNA gen

Hrčak ID:

169828

URI

https://hrcak.srce.hr/169828

Publication date:

22.11.2016.

Article data in other languages: english

Visits: 1.617 *