Original scientific paper

QTL KARTIRANJE ZA SVOJSTVA KVALITETE ZRNA KOD TESTKRIŽANACA BIPARENTALNE POPULACIJE KUKURUZA KORIŠTENJEM PODATAKA GENOTIPIZACIJE SEKVENCIRANJEM

Vlatko Galić ; Agricultural Institute Osijek, Department of Maize Breeding and Genetics, Južno predgrađe 17, 31103 Osijek, Croatia
Mario Franić ; Agricultural Institute Osijek, Department of Maize Breeding and Genetics, Južno predgrađe 17, 31103 Osijek, Croatia
Antun Jambrović ; Agricultural Institute Osijek, Department of Maize Breeding and Genetics, Južno predgrađe 17, 31103 Osijek, Croatia
Zvonimir Zdunić ; Centre of Excellence for Biodiversity and Molecular Plant Breeding, Svetošimunska 25, 10000 Zagreb, Croatia
Andrija Brkić ; Agricultural Institute Osijek, Department of Maize Breeding and Genetics, Južno predgrađe 17, 31103 Osijek, Croatia
Domagoj Šimić ; Agricultural Institute Osijek, Department of Maize Breeding and Genetics, Južno predgrađe 17, 31103 Osijek, Croatia

Abstract

Proveli smo QTL kartiranje u test križancima IBMSyn4 populacije za tri svojstva kvalitete zrna: sadržaj ulja i proteina te hektolitarsku masu. 191 fenotipizirana i genotipizirana linija korištena je kao “training” populacija, dok je 85 linija, koje su bile samo genotipizirane, činilo „validacijsku“ populaciju pri izračunavanju najboljih linearnih nepristranih predviđanja (BLUP). QTL analiza provedena je na ukupno 276 fenotipova. 92000 filtriranih SNP markera, dobivenih genotipizacijom sekvenciranjem (GBS), korišteno je za izračun BLUP-ova, dok je set od 2178 genetski kartiranih SSR markera korišten za QTL analizu. Pri jednostavnom QTL skeniranju, detektirali smo nekoliko QTL-ova slabijega fenotipskoga učinka: jedan za sadržaj ulja (kromosom 1), jedan za sadržaj proteina (kromosom 10) i četiri za hektolitarsku masu (kromosomi 1, 3, 5 i 10). QTL-ovi povezani s hektolitarskom masom imali su aditivno djelovanje te je njihovim združenim djelovanjem objašnjeno 18.25% fenotipske varijance. Samo jedan QTL za hektolitarsku masu na petome kromosomu bio je statistički značajan pri kompozitnom intervalnom kartiranju. Navedeni QTL podržava 9.97% fenotipske varijance. QTL-ovi detektirani u ovom istraživanju predstavljaju monitoring komercijalno najuspješnije elitne germplazme za svojstva kvalitete zrna.

Keywords

najbolja linearna nepristrana predviđanja; IBM populacija; kukuruz; lokusi kvantitativnih svojstava; svojstva kvalitete zrna

Hrčak ID:

182881

URI

https://hrcak.srce.hr/182881

Publication date:

7.6.2017.

Article data in other languages: english

Visits: 1.566 *