Original scientific paper

https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.170613a

Otkrivanje i karakterizacija rotavirusa genogrupe 5 povezanog s proljevom prasadi u sjeveroistočnoj Indiji

Hosterson Kylla ; Department of Veterinary Microbiology, Central Agricultural University, Selesih, Aizawl, Mizoram, India
Tapan K. Dutta ; Department of Veterinary Microbiology, Central Agricultural University, Selesih, Aizawl, Mizoram, India
Parimal Roychoudhury ; Department of Veterinary Microbiology, Central Agricultural University, Selesih, Aizawl, Mizoram, India
Rajkumari Mandakini ; Department of Veterinary Microbiology, Central Agricultural University, Selesih, Aizawl, Mizoram, India
Prashant K. Subudhi ; Department of Veterinary Microbiology, Central Agricultural University, Selesih, Aizawl, Mizoram, India

Abstract

Rotavirusi su prepoznati kao važan etiološki čimbenik nebakterijskog akutnog gastroenteritisa kod male djece i različitih vrsta životinja. Kod prasadi to uključuje i proljev koji se pojavljuje pri odbiću i nakon odbića. U ovom je radu prikazana prevalencija i molekularna epidemiologija rotavirusa otkrivenih kod prasadi iz različitih dijelova sjeveroistočnog, brdovitog područja Indije. U razdoblju od srpnja 2013. do lipnja 2015. godine, tijekom različitih sezona, prikupljeno je ukupno 457 uzoraka fecesa (339 proljevastih i 118 neproljevastih). Uzorci su potjecali od prasadi lokalnih (n = 130) i križnih pasmina (n = 327). Svi su uzorci podvrgnuti RNA-PAGE i RT-PCR analizama. Rotavirusi su otkriveni u 4,81 % životinja pomoću RNA-PAGE i 7,43 % životinja pomoću RT-PCR analize. Najveća prevalencija (9,67 %) utvrđena je u državi Meghalaya. Svi su izolati registrirani kao GARV i genogrupa 5. Prevalencija je bila viša u slabo organiziranim farmama (10,77 %) u usporedbi s dobro organiziranim farmama (4,0 %), s većom učestalošću otkrivanja kod životinja koje su imale proljev (9,14 %) u odnosu na životinje bez proljeva (2,54 %). Također, veća je prevalencija utvrđena tijekom ljetnih (12,5 %) i zimskih (9,09 %) sezona. Na temelju analize sekvencija svi su izolati smješteni u jedinstveni pojedinačni skup (klaster). Taj je skup različit od drugih indijskih izolata ljudi i životinja u kojima je bio u neposrednoj blizini izolata ljudi. Ovo je prvo izvješće o otkrivanju rotavirusa G5 povezanih s proljevom prasadi u Indiji.

Keywords

rotavirus; prevalencija; Indija; genogrupa 5; prasad

Hrčak ID:

203969

URI

https://hrcak.srce.hr/203969

Publication date:

14.7.2018.

Article data in other languages: english

Visits: 1.496 *