Review article

Metode izdvajanja i dokazivanja bakterija roda Campylobacter – metode genotipizacije (II. dio)

Marina Mikulić ; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Andrea Humski ; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Bela Njari ; Veterinarski Fakultet Sveučilišta u Zagrebu, Hrvatska
Dora Stojević ; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Luka Jurinović ; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Silvio Spičić ; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Sanja Duvnjak ; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska
Željko Cvetnić ; Hrvatski veterinarski institut, Zagreb, Hrvatska

Abstract

Različite metode genotipizacije omogućuju razlikovanje bakterijskih sojeva ispod razine vrste ili podvrste. Gel elektroforeza u pulsirajućem polju (PFGE) neprestano se usavršava od 1980-tih godina i do danas je upotrebljavaju mnogi javnozdravstveni laboratoriji. Od ostalih metoda koriste se: metoda analize duljine polimorfizma restrikcijskih odsječaka (RFLP), metoda nasumično umnoženih poliformnih odsječaka (RAPD) i metoda ribotipizacije. Određivanje redoslijeda nukleotidnih sljedova unutar DNK naziva se sekvenciranje. Na osnovi sekvenciranja bazira se rad novih metoda tipizacije određivanjem sljedova nukleotida na više genskih lokusa poput MLST, rMLST i cgMLST. One istražuju odnose između bakterija roda Campylobacter, posebice C. jejuni i C. coli. Korisne su u istraživanju mogućih izvora i rezervoara uzročnika bolesti, njihovih odnosa te molekularne epidemiologije bolesti. Metoda sekvenciranja cijelog genoma (WGS) u mikrobiologiji revolucionarna je metoda za koju se smatra da će postupno zamijeniti ostale metode genotipizacije.

Keywords

Campylobacter spp.; razlikovanje sojeva; tipizacija sekvenciranjem; PFGE

Hrčak ID:

222644

URI

https://hrcak.srce.hr/222644

Publication date:

15.10.2017.

Article data in other languages: english

Visits: 1.892 *