Original scientific paper

https://doi.org/10.46419/vs.52.1.6

Polimorfizmi lokusa CAPN, CAST, LEP, GH, GHR, IGF-1 i MSTN u križanaca kreolske dlakave ovce iz Kolumbije s ovcama pelibuey pasmine

Claudia Lenis-Valencia orcid.org/0000-0003-4846-6646 ; Fakultet poljoprivrednih znanosti, Nacionalni Univerzitet u Kolumbiji, Kolumbija
Darwin Hernández-Herrera orcid.org/0000-0002-1758-604X ; Fakultet poljoprivrednih znanosti, Nacionalni Univerzitet u Kolumbiji, Kolumbija
Luz Álvarez-Franco ; Fakultet poljoprivrednih znanosti, Nacionalni Univerzitet u Kolumbiji, Kolumbija

Abstract

Cilj ove studije bio je okarakterizirati polimorfizam pojedinačnih nukleotida kod Calpaina (CAPN), kalpastatina (CAST), leptina (LEP), hormona rasta (GH), receptora hormona rasta (GHR), inzulinu sličnog čimbenika rasta 1 (IGF-1) i miostatina (MSTN) u križanaca kreolske dlakave ovce iz Kolumbije s ovcama pelibuey pasmine. U 192 jedinke, lokusi CAST i MSTN genotipizirani su PCR-RFLP, a loci CAPN, GH, GHR, IGF-1 i LEP pomoću PCR-SSCP i sekvenci. Izračunati su sljedeći pokazatelji: alelna i genotipska frekvencija, uočena (Ho) i očekivana heterozigotnost (He), indeks fiksacije i odstupanja od ravnoteže Hardy-Weinberga (HWE). U lokusu CAPN nađene su veće frekvencije alela T (70 %) u odnosu na C (30 %), a frekvencije genotipa TT (46 %) i TC (48 %) su nadmašile CC (6 %). Kod CAST-a, MM genotip (83 %) je bio najčešći, a slijede ga ostali genotipovi (MN: 16 % i NN 0,5 %), tako da su alelne frekvencije bile M: 91 % i N: 9%. Alel A (66 %) lokuse LEP bio je češći od alela G (34 %), a AA, AG i GG genotipovi imali su frekvencije 43, 47 i 10 %. U lokusu GH pronađene su samo dva genotipa (AA: 64 % i AG: 36 %) s alelnim frekvencijama 82 i 18 % za A i G. U lokusu IGF-1, genotipovi AA, GG i
AG prikazali su frekvencije od 36, 49 i 15 %, s većom prisutnošću alela G (56 %) od A (44 %). U analiziranoj populaciji, lokusi GHR i MSTN bili su monomorfni, a u svakom su pronađeni samo AA i MM genotipovi. Lokusi CAST, GH i IGF-1 pokazali su odstupanja od HWE.
Jedino je u IGF-1 lokusu ustanovljen manjak He. Lokusi CAPN, CAST, LEP, GH i IGF-1 bili su polimorfni s visokim He i viškom heterozigota. Nasuprot tome, lokusi GHR i MST bili su monomorfni. Rezultati prikazani u ovom istraživanju mogu se koristiti u programima uzgoja životinja.

Keywords

uzgoj životinja; genetska raznolikost; zoogenetski resurs

Hrčak ID:

239427

URI

https://hrcak.srce.hr/239427

Publication date:

25.11.2020.

Article data in other languages: english

Visits: 1.862 *