Veterinarska stanica, Vol. 52 No. 6, 2021.
Original scientific paper
https://doi.org/10.46419/vs.52.6.5
Molekularna filogenija i genetička raznolikost domaćih jakova (Bos grunniens) u Pakistanu na temelju mitohondrijskih i mikrosatelitskih markera
Tanveer Hussain
; Zavod za molekularnu biologiju, Virtual Univerzitet u Pakistan, Lahore, Pakistan
Abdul Wajid
; Zavod za molekularnu biologiju, Virtual Univerzitet u Pakistan, Lahore, Pakistan
Mudassir Soail
; Zavod za stočarstvo i mljekarstvo, Gilgit Baltistan, Pakistan
Akhtar Ali
; Zavod za molekularnu biologiju, Virtual Univerzitet u Pakistan, Lahore, Pakistan
Kamran Abbas
; Zavod za molekularnu biologiju, Virtual Univerzitet u Pakistan, Lahore, Pakistan
Faiz M. M. T. Marikar
orcid.org/0000-0003-4579-7263
; General Sir John Kotelawala Defense Univerzitet, Ratmalana, Šri Lanka; Zavod za zdravstveno obrazovanje i istraživanje, The Open Univerzitet u Šri Lanci
Muneeb M. Musthafa
; Zavod za tehnološke biosustave Fakultet Tehnologije, South Eastern Univerzitet u Šri Lanci, Univerzitet Park, Oluvil, Šri Lanka
Ellahi Babar
; Zavod za molekularnu biologiju, Virtual Univerzitet u Pakistan, Lahore, Pakistan
Abstract
Za pakistanskog domaćeg jaka (Bos grunniens) iz obitelji šupljorožaca (Bovidae), sekvenciran je cjelokupni citokromni b gen i djelomice kontrolna regija mtDNK. Genoti¬pizirano je tri stotine uzoraka uporabom 27 goveđih mikrosatelitskih markera pasmine Gilgit-Baltistan i Skardu iz Pakistana. Identifi¬cirali smo ukupno 35 mutacija i 9 haplotipova na temelju sekvencija D-petlje uz haplotipsku i nukleotidnu raznolikost od 0,9640±0,051, od¬nosno 0,02172±0,00224. Za citokromni b gen, ukupno 23 varijabilne lokacije i šest različi¬tih haplotipova zamijećeno je s 0,885±0,067 haplotipskom i 0,00989±0,003 nukleotidnom raznolikošću. Filogenetska analiza D-petlje i citokromnog b gena ukazala je da se sekven¬ce domaćih jakova grupiraju u dvije vrlo di¬vergentne loze po majci (loza I i II), dok su identificirane tri haplogrupe A, C i D od ranije poznatih šest haplogrupa. Haplogrupe A i C bile su dominantne i široko rasprostranjene među svim istraženim uzorcima jakova. Svi mikrosateliti bili su polimorfni te je zamijeće¬no ukupno 138 alela, s prosječnim sadržajem polimorfne informacije (PIC) od 0,56 ukazu¬jući na njihovu učinkovitost. Zamijećena je prosječna heterozigotnost od 0,6071 s alelnom raznolikošću 5,1111 i genetskom raznolikošću 0,4830. Implikacije ovih nalaza mogu se rabiti za očuvanje populacije jakova.
Keywords
domaći jak; mtDNK petlja; citokromni b gen; mikrosateliti; filogenija; Pakistan
Hrčak ID:
249036
URI
Publication date:
2.5.2021.
Visits: 1.075 *