Stručni rad
DNA barkodiranje kao alat za identifikaciju karantenskih vrsta kukaca
Ivana Križanac
; Hrvatska agerncija za poljoprivredu i hranu, Centar za zaštitu bilja, Zagreb
*
Maja Pintar
; Hrvatska agerncija za poljoprivredu i hranu, Centar za zaštitu bilja, Zagreb
Mladen Šimala
; Hrvatska agencija za poljoprivredu i hranu, Centar za zaštitu bilja, Zagreb
Andrijana Novak
; Hrvatska agerncija za poljoprivredu i hranu, Centar za zaštitu bilja, Zagreb
* Dopisni autor.
Sažetak
Broj prioritetnih i reguliranih vrsta štetnika na karantenskim listama Europske unije sve je veći. Specijalisti dijagnostičari, posebice entomolozi, susreću se s novim vrstama, ali i razvojnim stadijima (ličinke ili jaja) za koje je precizna identifikacija na temelju morfoloških obilježja nemoguća. Molekularna dijagnostika pruža potporu u identifikaciji vrsta karantenskih štetnih organizama i drugih invazivnih vrsta. DNA barkodiranje metoda je kojom se organizmi mogu precizno identificirati na temelju slijeda nukleotida (sekvencija) u odabranom genu ili genima. Već duže se koristi kao alat za identifikaciju vrsta više skupina životinja, biljaka i mikroorganizama. Za identifikaciju vrsta kukaca kao standardni „barkod“ najčešće se koristi fragment 5' regije mitohondrijskog gena za podjedinicu I citokrom c oksidaze (COI). Slijed nukleotida u ciljanom fragmentu DNA (DNA sekvencija) uspoređuje se s DNA sekvencijama iz referentnih baza podataka.
Ključne riječi
molekularna dijagnostika; DNA sekvencija; COI; identifikacija vrste; nedestruktivna ekstrakcija DNA; invazivne vrste
Hrčak ID:
321629
URI
Datum izdavanja:
13.9.2024.
Posjeta: 0 *