hrcak mascot   Srce   HID

Veterinarski arhiv, Vol. 84 No. 3, 2014.

Izvorni znanstveni članak

Kulturelna i metagenomska identifikacija mikrobioma kod supkliničkog mastitisa u krava.

Bharat B. Bhanderi ; Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand, Gujarat, India
Mayurdhvaj K. Jhala ; Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand, Gujarat, India
Viral B. Ahir ; Department of Animal Biotechnology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand, Gujarat, India
Vaibhav D. Bhatt ; Department of Animal Biotechnology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand, Gujarat, India
Chaitanya G. Joshi ; Department of Animal Biotechnology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand, Gujarat, India

Puni tekst: engleski, pdf (198 KB) str. 215-228 preuzimanja: 763* citiraj
APA 6th Edition
Bhanderi, B.B., Jhala, M.K., Ahir, V.B., Bhatt, V.D. i Joshi, C.G. (2014). Cultural and metagenomic based identification of a microbiome from subclinical mastitis in cows.. Veterinarski arhiv, 84 (3), 215-228. Preuzeto s https://hrcak.srce.hr/121943
MLA 8th Edition
Bhanderi, Bharat B., et al. "Cultural and metagenomic based identification of a microbiome from subclinical mastitis in cows.." Veterinarski arhiv, vol. 84, br. 3, 2014, str. 215-228. https://hrcak.srce.hr/121943. Citirano 24.04.2019.
Chicago 17th Edition
Bhanderi, Bharat B., Mayurdhvaj K. Jhala, Viral B. Ahir, Vaibhav D. Bhatt i Chaitanya G. Joshi. "Cultural and metagenomic based identification of a microbiome from subclinical mastitis in cows.." Veterinarski arhiv 84, br. 3 (2014): 215-228. https://hrcak.srce.hr/121943
Harvard
Bhanderi, B.B., et al. (2014). 'Cultural and metagenomic based identification of a microbiome from subclinical mastitis in cows.', Veterinarski arhiv, 84(3), str. 215-228. Preuzeto s: https://hrcak.srce.hr/121943 (Datum pristupa: 24.04.2019.)
Vancouver
Bhanderi BB, Jhala MK, Ahir VB, Bhatt VD, Joshi CG. Cultural and metagenomic based identification of a microbiome from subclinical mastitis in cows.. Veterinarski arhiv [Internet]. 2014 [pristupljeno 24.04.2019.];84(3):215-228. Dostupno na: https://hrcak.srce.hr/121943
IEEE
B.B. Bhanderi, M.K. Jhala, V.B. Ahir, V.D. Bhatt i C.G. Joshi, "Cultural and metagenomic based identification of a microbiome from subclinical mastitis in cows.", Veterinarski arhiv, vol.84, br. 3, str. 215-228, 2014. [Online]. Dostupno na: https://hrcak.srce.hr/121943. [Citirano: 24.04.2019.]

Sažetak
Radi identifikacije mikrobne zajednice u mlijeku provedena je metagenomska i uobičajena kulturelna pretraga uzoraka mlijeka krava sa supkliničkim mastitisom. Ukupno je 77 trostruko križanih Kankrej i Gir mliječnih krava i 301 četvrt vimena bilo pretraženo na supklinički mastitis. Izdvojeno je bilo 106 izolata svrstanih u pet različitih rodova iz 91 četvrti od 41 krave uključujući i 15 četvrti kod kojih je kulturelnom pretragom bila ustanovljena mješovita bakterijska infekcija. Sljedovi mješavine DNA izdvojeni iz uzoraka mlijeka kod supkliničkog mastitisa očitani pirosekvenciranjem bili su analizirani po podsustavu SEED baze podataka „Meta Genome Rapid Annotation with Subsystem Technology (MG-RAST)“. Iz pretraženih uzoraka mlijeka bilo je izdvojeno pet rodova: Staphylococcus, Streptococcus, Micrococcus, Bacillus i Escherichia. Četiri su bila dokazana postupkom pirosekvenciranja: Staphylococcus, Streptococcus, Bacillus i Escherichia, dok Micrococcus nije bio dokazan. S druge strane, pirosekvenciranjem je bilo dokazano 28 bakterijskih vrsta, od kojih su samo dvije, S. aureus i E. coli, bile dokazane klasičnom kulturelnom pretragom. S. agalactiae, treća vrsta identificirana kulturelnom pretragom nije bila dokazana postupkom pirosekvenciranja. Metagenomskom analizom dodatno je bilo dokazano 19 rodova i 26 vrsta u usporedbi s rutinskom kulturelnom pretragom. Mnoge anaerobne bakterije, koje je vrlo teško uzgojiti rutinskim metodama, bile su identificirane metagenomskom analizom.

Ključne riječi
supklinički mastitis; metagenomika; krave

Hrčak ID: 121943

URI
https://hrcak.srce.hr/121943

[engleski]

Posjeta: 923 *