Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.2478/cjf-2019-0004
RAPD I ISSR ANALIZA GENETIČKE RAZNOLIKOSTI I STRUKTURE POPULACIJE UGROŽENE VRSTE Amblyceps mangois IZ POD-HIMALAJSKOG ZAPADNOG BENGALA, INDIJA
Tanmay Mukhopadhyay
; Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Zoology, University of North Bengal, P.O. North Bengal University, Raja Rammohunpur, Siliguri, District Darjeeling, West Bengal, PIN- 734 013, India
Soumen Bhattacharjee
; Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Zoology, University of North Bengal, P.O. North Bengal University, Raja Rammohunpur, Siliguri, District Darjeeling, West Bengal, PIN- 734 013, India
Sažetak
Amblyceps mangois ili “indijski bujični som” je tropska, slatkovodna, vrsta brdskih potoka koja u Indiji ima ukrasno-komercijalnu vrijednost a uključena je u kategoriju “ugrožene” na popisu ugroženih slatkovodnih riba Indije. Kako bi se, uz pomoć markera RAPD i ISSR, istražila genetička arhitektura ove vrste, analizirano je ukupno četrnaest populacija iz regije Terai i Dooars na sjeveru Zapadnog Bengala u Indiji. Opaženi broj alela (S), Neiova genska raznolikost (H) i Shannonov indeks podataka (H´ ili I) ukazali su na najviše vrijednosti u riječnom slivu Teesta i najniže vrijednosti u slivu rijeke Mahananda. Dendrogram na bazi UPGMA i PCoA, temeljeni na RAPD i ISSR otiscima, ukazale su na formiranje skupine populacije rijeka Mahananda i Teesta koja se razlikuje od preostale populacije rijeke Jaldhaka. Četrnaest riječnih populacija su dalje razmatrane u devet skupina premakontinuitetu protoka vode za SHE analizu. Utvrđeno je da su tri komponente tj. uzorak raznolikosti (H‘), bogatstva (S) i jednolikosti (E), varirale i fluktuirale u svih četrnaestpopulacija s više na nižu nadmorsku visinu, kako rijeka teče nizvodno. AMOVA, PhiPT i genetske hijerarhijske analize ukazale su na izrazitu hijerarhijsku strukturu prisutnu u populaciji Ambliceps na istraživanom području. U istraživanju su nađene niske razine genetske raznolikosti/varijacija i genetska hijerarhijska struktura s visokom genetskom divergencijom, kao pokazatelj nedavne slike ugroženog statusa ove vrste. Ova studija je početni pokušaj karakterizacije i procjene genetske arhitekture ribljih vrsta iz ove regije i postoji prostor za upravljanje značajnim jedinicama evolucije (ESU) u svrhu njihovog očuvanja.
Ključne riječi
indijski bujični som; genetska hijerarhija; she analiza; sub-himalajski hotspot
Hrčak ID:
218074
URI
Datum izdavanja:
19.3.2019.
Posjeta: 1.276 *