Veterinarski arhiv, Vol. 90 No. 4, 2020.
Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.24099/vet.arhiv.0862
Raznolikost lokusa DrB gena MHC klase ii u jelena običnoga (Cervus elaphus) iz gorskoga područja Hrvatske
Miljenko Bujanić
; Department of Veterinary Economics and Epidemiology, The Faculty of Veterinary Medicine, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Elena Bužan
; Department of Biodiversity, Faculty of Mathematics, Natural Sciences and Information Technologies, University of Primorska, Koper, Slovenia
Ana Galov
; Division of Animal Physiology, Department of Biology, Faculty of Science, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Haidi Arbanasić
; Division of Animal Physiology, Department of Biology, Faculty of Science, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Sandra Potušek
; Department of Biodiversity, Faculty of Mathematics, Natural Sciences and Information Technologies, University of Primorska, Koper, Slovenia
Sunčica Stipoljev
; Department of Fisheries, Beekeping, Game Management and Special Zoology, Faculty of Agriculture, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Nikica Šprem
; Department of Fisheries, Beekeping, Game Management and Special Zoology, Faculty of Agriculture, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Krešimir Križanović
; Department of Electronic Systems and Information Processing, Faculty of Electrical Engineering and Computing, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Dean Konjević
; Department of Veterinary Economics and Epidemiology, The Faculty of Veterinary Medicine, University of Zagreb, Zagreb, Croatia
Sažetak
Jelen obični (Cervus elaphus) jest zavičajna vrsta divljači u Republici Hrvatskoj. Unatoč činjenici da glavni sustav tkivne podudarnosti ima vodeću ulogu u pokretanju imunosnog odgovora, nema dostupnih podataka o njegovoj varijabilnosti u jelena običnog na području Hrvatske. U ovom je radu istražena raznolikost lokusa DRB gena MHC klase II na uzorku od 23 jelena iz gorskoga staništa (Gorski kotar). Sekvenciranje nove generacije (NGS) potvrdilo je postojanje 23 jedinstvene sekvencije DRB egzona II, od kojih je prethodno identificirano svega 6. Broj alela kolebao je od 1 do 6 (prosjek 3,09) po životinji, dok je jedna jedinka imala svega 1 alel, a jedna svih šest alela. Najčešći alel, Ceel-DRB*HR01, utvrđen je u 21 jedinci (16,9 %). Broj varijabilnih nukleotidnih mjesta bio je 84 (33,7 %), a broj varijabilnih pozicija aminokiselina 44 (53 %). Prosječna evolucijska udaljenost nukleotida, temeljena na Jukes- Cantorovu modelu, s gama-distibucijskim parametrom, bila je 16,5 %, dok je nukleotidna udaljenost sekvencija (temeljena na baznim parovima) iznosila od 0,04 % do 14,24 %. Aminokiselinska evolucijska udaljenost, temeljena na Jones-Taylor-Thorntonovu modelu, iznosila je 34,7 %. Usporedbom s literaturom vidljivo je da gorska populacija jelena običnoga u Hrvatskoj posjeduje zadovoljavajuću raznolikost na lokusu DRB, što je nadalje potvrđeno primjetnom nukleotidnom evolucijskom udaljenošću.
Ključne riječi
jelen obični; geni MHC; lokus DRB; raznolikost; gorsko stanište
Hrčak ID:
245190
URI
Datum izdavanja:
22.10.2020.
Posjeta: 745 *