Skoči na glavni sadržaj

Kemija u industriji : Časopis kemičara i kemijskih inženjera Hrvatske, Vol. 72 No. 11-12, 2023.

Izvorni znanstveni članak

https://doi.org/10.15255/KUI.2023.013

Procjena afiniteta vezanja DNA ksantenskih spojeva: in vitro i in silico pristup

Elma Veljović orcid id orcid.org/0000-0003-1129-1491 ; Univerzitet u Sarajevu, Farmaceutski fakultet, Zmaja od Bosne 8, 71 000 Sarajevo, Bosna i Hercegovina
Amar Osmanović orcid id orcid.org/0000-0002-4206-6177 ; Univerzitet u Sarajevu, Farmaceutski fakultet, Zmaja od Bosne 8, 71 000 Sarajevo, Bosna i Hercegovina
Mirsada Salihović orcid id orcid.org/0000-0001-7497-4084 ; Univerzitet u Sarajevu, Farmaceutski fakultet, Zmaja od Bosne 8, 71 000 Sarajevo, Bosna i Hercegovina
Nevzeta Ljubijankić ; Univerzitet u Sarajevu, Prirodno-matematički fakultet, Zmaja od Bosne 33-35, 71 000 Sarajevo, Bosna i Hercegovina
Sabina Begić orcid id orcid.org/0000-0002-3523-8268 ; Univerzitet u Sarajevu, Prirodno-matematički fakultet, Zmaja od Bosne 33-35, 71 000 Sarajevo, Bosna i Hercegovina
Selma Špirtović-Halilović ; Univerzitet u Sarajevu, Farmaceutski fakultet, Zmaja od Bosne 8, 71 000 Sarajevo, Bosna i Hercegovina

Puni tekst: engleski pdf 800 Kb

str. 651-656

preuzimanja: 42

citiraj

Sažetak

Derivati ksantena važna su klasa heterocikličkih spojeva sa širokim spektrom farmakoloških aktivnosti. U našim prethodnim istraživanjima pronašli smo dobru antiproliferativnu aktivnost dvaju derivata ksantena, s minimalnom toksičnošću ispitanom in vitro testovima. U ovoj smo studiji testirali interakciju spoja 1 (snažan antiproliferativni spoj) s DNA telećeg timusa (CT-DNA) u fiziološkim uvjetima spektrofotometrijskom titracijom. Predviđanje vezanja i vrsta interakcijskih sila uključenih u raspored između derivata ksantena i CT-DNA također su istraženi kroz studije molekularnog spajanja.
Rezultati su pokazali da spoj 1 stupa u interakciju s CT-DNA grove vezanjem. Nađeno je da konstanta vezanja iznosi 2,5 ∙ 104 M–1 i ukazuje na nekovalentno vezanje spoja 1 na CT-DNA. Rezultati docking studije predstavljaju moguće načine vezanja, s energijama vezanja od −9,39 odnosno −8,65 kcal mol–1 za spojeve 1 i 2, što je u skladu s prethodno dobivenim in vitro rezultatima za antiproliferativno djelovanje.
Uz eksperimentalno istraživanje, izračun teorije funkcionalne gustoće (DFT) s razinama teorija B3LYP/6-31G*, B3LYP/6-31G** i B3LYP/6-31+G* proveden je na spojevima 1 i 2 da bi se dobila optimizirana geometrija, spektroskopska i elektronička svojstva.
Ove studije mogle bi pomoći u razumijevanju mehanizama toksičnosti, otpornosti, nuspojava derivata ksantena i njihovog mehanizma djelovanja na DNA.

Ključne riječi

DNA vezanje; docking; DFT; ksanten

Hrčak ID:

309708

URI

https://hrcak.srce.hr/309708

Datum izdavanja:

11.11.2023.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 144 *