Izvorni znanstveni članak

https://doi.org/10.2478/aiht-2025-76-3973

Utjecaj inaktivacije topline na RT-qPCR detekciju teškog akutnog respiratornog sindroma Coronavirus-2 (SARS-CoV-2): iskustvo Sveučilišnog kliničkog centra Vojvodine, Srbija

Jelena Stojčević Maletić orcid.org/0000-0002-9962-0810 ; University of Novi Sad Faculty of Medicine, Novi Sad, Serbia 2 University Clinical Centre of Vojvodina, Novi Sad, Serbia
Iva Barjaktarović orcid.org/0000-0003-2460-3458 ; University of Novi Sad Faculty of Medicine, Novi Sad, Serbia 2 University Clinical Centre of Vojvodina, Novi Sad, Serbia
Ljiljana Andrijević ; University of Novi Sad Faculty of Medicine, Novi Sad, Serbia
Katarina Bačulov orcid.org/0000-0003-1827-2824 ; University of Novi Sad Faculty of Medicine, Novi Sad, Serbia 2 University Clinical Centre of Vojvodina, Novi Sad, Serbia
Slobodanka Bogdanović Vasić orcid.org/0009-0000-6555-7924 ; Šabac Academy of Vocational Studies, Šabac, Serbia
Diandra Pintać Šarac ; University of Novi Sad Faculty of Medicine, Novi Sad, Serbia

Sažetak

Rukovanje kliničkim uzorcima pacijenata sa sumnjom na infekciju virusom SARS-CoV-2 potencijalni je rizik od izloženosti infektivnim česticama među zdravstvenim djelatnicima. Toplinska inaktivacija uzoraka prije izolacije nukleinskih kiselina može poboljšati biosigurnost tijekom testiranja, ali i utjecati na analitičku osjetljivost testa. Ovim je istraživanjem procijenjen učinak toplinske inaktivacije (56 °C tijekom 30 minuta) na rezultate RT-qPCR analize brisova nazofarinksa i orofarinksa (NF/OF), prikupljenih od 200 simptomatskih pacijenata. Svaki je uzorak podijeljen u dva alikvota: jedan je podvrgnut toplinskoj inaktivaciji, a drugi pohranjen na 4 °C, nakon čega su provedene izolacija nukleinskih kiselina i RT-qPCR analiza korištenjem GeneFinder COVID-19 testa nukleinskih kiselina. Toplinska inaktivacija nije značajno utjecala na ukupnu stopu detekcije SARS-CoV-2 (55,5 % prema 55,0 % u netretiranim i toplinski tretiranim skupinama; χ²=0,01, p=0,91). Međutim, razlike su zabilježene u 15,3 % uzoraka, svi s vrijednostima kvantifikacijskog ciklusa (Cq)>31, uključujući gubitak ili pojavu cilja te potpuni nestanak signala nakon tretmana. Toplinska inaktivacija blago je smanjila vrijednosti Cq za RdRp i E gene, a povećala za N gen, uz značajne promjene u skupini visokopozitivnih uzoraka (Cq≤33). U skupini pozitivnih uzoraka (Cq≤40), gen za humanu Rnazu P također je pokazao značajno više vrijednosti Cq nakon toplinskog tretmana. U podskupini visokopozitivnih uzoraka, analiza korelacije pokazala je umjereno slaganje za RdRp, vrlo snažnu korelaciju za N i E te slabiju podudarnost u niskopozitivnim uzorcima. Zaključeno je da toplinska inaktivacija na 56 °C tijekom 30 minuta ne utječe značajno na detekciju virusnih gena, ali ju može smanjiti u uzorcima s niskim virusnim opterećenjem.

Ključne riječi

gen za humanu RNazu P; GeneFinder test nukleinskih kiselina; izolacija RNA; kvantifikacijski ciklus; kvantitativna lančana reakcija polimerazom u stvarnom vremenu; nazofaringealni brisovi; orofaringealni brisovi

Hrčak ID:

342187

URI

https://hrcak.srce.hr/342187

Datum izdavanja:

23.12.2025.

Podaci na drugim jezicima: engleski

Posjeta: 477 *