Preliminary communication
https://doi.org/10.17113/ftb.56.01.18.5445
Korelacija između primarne strukture proteina i razine ekspresije topljivog proteina HSA dAb u bakteriji Escherichia coli
Yankun Yang
; The Key Laboratory of Carbohydrate Chemistry and Biotechnology, School of Biotechnology, Jiangnan University, Ministry of Education
Guoqiang Liu
; The Key Laboratory of Carbohydrate Chemistry and Biotechnology, School of Biotechnology, Jiangnan University, Ministry of Education
Meng Liu
; National Engineering Laboratory for Cereal Fermentation Technology, Jiangnan University
Zhonghu Bai
; National Engineering Laboratory for Cereal Fermentation Technology, Jiangnan University
Xiuxia Liu
; National Engineering Laboratory for Cereal Fermentation Technology, Jiangnan University
Xiaofeng Dai
; Jiangsu Provincial Research Center for Bioactive Product Processing Technology, Jiangnan University
Wenwen Guo
; The Key Laboratory of Industrial Biotechnology, Ministry of Education, School of Biotechnology, Jiangnan University
Abstract
Izoelektrična točka, duljina molekule, molekularna masa i slijed aminokiselina bitno utječu na topljivost proteina. U ovom smo se radu fokusirali na sastav aminokiselina i ispitali one koje najviše utječu na razinu ekspresije topljivog protutijela albumina iz ljudskog seruma (HSA dAb). Grupiranjem i primjenom linearnog modela analizirana je topljivost 65 varijanti proteina. Bitan utjecaj na ekspresiju topljivog protutijela dAb imale su specifične kombinacije aminokiselina, i to (S, R, N, D, Q) u supernatantu, (G, R, C, N, S) u lizatu peleta i (R, S, G) u ukupnom topljivom protutijelu dAb. Od 20 aminokiselina, arginin je imao negativan, a glicin i serin su imale pozitivan učinak na razinu ekspresije topljivog proteina. Preciznost linearnog modela predviđanja topljivosti proteina bila je 80 %. Zaključeno je da se povećanjem udjela polarnih aminokiselina, osobito glicina i serina, te smanjenjem udjela arginina bitno povećala ekspresija topljivog proteina HSA dAb.
Keywords
domena protutijela (dAb); Escherichia coli; heterologna ekspresija proteina; linearni model; primarna struktura
Hrčak ID:
197382
URI
Publication date:
30.3.2018.
Visits: 1.491 *