Original scientific paper

Analiza metilacije CpG kao moguće drugačije metode metilacije Xist gena u somatskih stanica koze (Capra hircus).

Bikash R. Prusty orcid.org/0000-0002-1691-9068 ; Division of Veterinary Biotechnology, Indian Veterinary Research Institute, Izatnagar, Bareilly, India
Dharmendra Kumar ; Animal Biotechnology Centre, MPPCVV, Jabalpur, India
Tapan K. Palai ; Division of Animal Biochemistry, Indian Veterinary Research Institute, Izatnagar, Bareilly, India
Subas C. Jena ; Division of Veterinary Biotechnology, Indian Veterinary Research Institute, Izatnagar, Bareilly, India
Megha K. Bedekar ; Central Institute of Fisheries and Education, Mumbai, Maharashtra, India
Sanjeev Singh ; National Bureau of Animal Genetic Resources, Karnal, Haryana, India
Bikash C. Sarkhel ; Animal Biotechnology Centre, MPPCVV, Jabalpur, India

Abstract

Inaktivacija X kromosoma složeni je epigenski postupak kojim se osigurava jednaka ekspresija većine X-vezanih gena kod oba spola. Xist (X kromosom specifični inaktivirajući transkript) je ključni gen povezan s razvojem koji potiče inaktivaciju X kromosoma kod ženki sisavaca tijekom embriogeneze. Metilacija DNA glavna je modifikacija kromatina uključena u transkripcijsku regresiju gena, regulaciju X kromosomske inaktivacije, genomskog utiska, specifičnu staničnu ili tkivnu gensku ekspresiju odnosno u mnoge druge procese tijekom embrionalnog razvoja. Prikladna DNA metilacija citozin-rezidua na CpG dinukleotidu, unutar metilacijske regije mnogih utišanih gena, prijeko je potrebna za normalni postimplantacijski razvoj embrija sisavaca. Nepravilan oblik DNA metilacije zbog nekompletnog ili poremećenog reprogramiranja u jezgi somatskih stanica razlog je manje uspješnosti njezinog prijenosa kod farmskih životinja. U ovom radu istražena je moguća druga metilacijska regija koja je utvrđena prvi put u koze (Capra hircus). Navedeno je omogućeno nakon istraživanja statusa DNA metilacije u toj regiji, primjenom analize bisulfit sekvenciranja, uz upotrebu fibroblasta i stanice kumulusa koze. Moguća nova metilirajuća regija sadrži 10 CpG mjesta s prosječnom razinom metilacije od 92% i 94% za fibroblaste odnosno stanica kumulusa. Filogenetske analize regije pokazale su da su koze i ovce smještene u jedan odvojeni “grozd”. Istraživanje će pomoći u budućem radu vezanom za molekularnu razinu koja je odgovorna za potpuno reprogramiranje jezgre somatskih stanica koza u SCNT.

Keywords

Xist gen; DNA metilacija; epigenetsko reprogramiranje; bisulfit-sekvenciranje; prijenos jezgre somatskih stanica; koze

Hrčak ID:

125125

URI

https://hrcak.srce.hr/125125

Publication date:

16.7.2014.

Article data in other languages: english

Visits: 2.129 *