Preliminary communication

https://doi.org/10.17113/ftb.56.01.18.5441

Sekvenciranjem rRNA gena visoke propusnosti otkrivena je raznolikost bakterijskih vrsta uključenih u fermentaciju brazilske kave

Dão Pedro de Carvalho Neto ; Bioprocess Engineering and Biotechnology Department, Federal University of Paraná Curitiba
Gilberto Vinícius de Melo Pereira ; Bioprocess Engineering and Biotechnology Department, Federal University of Paraná Curitiba
Júlio César de Carvalho ; Bioprocess Engineering and Biotechnology Department, Federal University of Paraná Curitiba
Vanete Thomaz Soccol ; Bioprocess Engineering and Biotechnology Department, Federal University of Paraná Curitiba
Carlos Ricardo Soccol ; Bioprocess Engineering and Biotechnology Department, Federal University of Paraná Curitiba

Abstract

Fermentacija kave je spontani proces koji se odvija već na plantaži, a u kojeg su uključene različite skupine mikroorganizama, poput bakterija i plijesni. U ovom je radu ispitana raznolikost i dinamika odnosa bakterija unutar populacije uključenih u fermentaciju brazilske kave, i to postupkom sekvenciranja visoke propusnosti. Iz uzoraka fermentirane kave izolirana je DNA u različitim vremenskim razmacima, te je pomoću visokopropusne metode Illumina sekvenciran gen 16S rRNA sa segmentima oko V4 varijabilne regije. Pronađeno je više od 80 vrsta bakterija, od kojih su mnoge po prvi put otkrivene tijekom fermentacije kave, poput vrsta Fructobacillus, Pseudonocardia, Pedobacter, Sphingomonas i Hymenobacter. Prisutnost bakterija vrste Fructobacillus potvrđuje njihov utjecaj na razgradnju fruktoze tijekom fermentacije. Temporalnom je analizom otkrivena dominacija bakterija mliječno-kiselog vrenja, i to pretežno vrsta Leuconostoc i Lactococcus, u više od 97 % sekvencija pri završetku fermentacije. HPLC analiza pokazala je da je zbog metaboličke aktivnosti bakterija mliječno-kiselog vrenja nastala veća količina mliječne kiseline tijekom fermentacije. Rezultati potvrđuju da je broj bakterijskih vrsta uključenih u fermentaciju kave bitno veći od očekivanog. Nove skupine bakterijskih vrsta pronađene u ovom istraživanju mogu poslužiti kao funkcionalne starter kulture za preradu kave na plantaži.

Keywords

bakterije mliječno-kiselog vrenja; fermentacija kave; dinamika bakterijske populacije; Fructobacillus sp

Hrčak ID:

197377

URI

https://hrcak.srce.hr/197377

Publication date:

30.3.2018.

Article data in other languages: english

Visits: 1.835 *