Original scientific paper
Mnogostruki, mutagenski odvojeni test lančane polimerazne reakcije podoban za brzo otkrivanje varijacija ljudske mitohondrijske DNA u kodnom području
Jin Wu
; Institute of Forensic Medicine, Sichuan University, China
Peng Ran
; Institute of Forensic Medicine, Sichuan University, China
Yingbi Li
; Institute of Forensic Medicine, Sichuan University, China
Jing Yan
; Institute of Forensic Medicine, Sichuan University, China
Miao Liao
; Institute of Forensic Medicine, Sichuan University, China
Yiping Hou
; Institute of Forensic Medicine, Sichuan University, China
Lin Zhang
; Institute of Forensic Medicine, Sichuan University, China
Abstract
Odnedavna se zna da informacija o kodnom podučju mitohondrijske DNA (mtDNA) može
omogućiti dodatno forenzičko razlikovanje osoba u usporedbi sa standardnom tipizacijom područja
petlje D. Time se povećava učinkovitost testiranja mtDNA, koja je inače prilično ograničena. U
ovom smo istraživanju uspjeli istodobno tipizirati polimorfizam kodnoga područja u deset
pojedinačnih nukleotida (single nucleotide polymorphism, SNP) i to uporabom mutagenski
odvojene lančane polimerazne reakcije (MS-PCR) u kineskoj Chengdu populaciji. U tome se
postupku rabe primeri različitih veličina specifični za alele, koji specifično amplificiraju oba alela
mtDNA u istoj reakciji. Susljedna elektroforeza u gelu potom je pokazala postojanje deset alelskih
produkata različitih lokusa. Uporabom mnogostrukoga testa MS-PCR, 30 primera je istodobno
dodano u jednu reakcijsku kušalicu da bi se identificiralo deset SNP-ova. Tako su ispitane inačice
mtDNA u 160 osoba koje pripadaju kineskoj populaciji Chengdu koje su se potom mogle razvrstati
u 18 haplotipova. Mnogostruki test MS-PCR podoban je za velika probirna istraživanja
varijabilnosti mtDNA, jer je brz i jeftin.
Keywords
mitohondrijski DNA; pojedinačne nukleotide; mutagenetski odvojene reakcije PCR; kineska Chengu populacija
Hrčak ID:
26087
URI
Publication date:
15.2.2008.
Visits: 1.636 *